RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365172.1

SNORD49B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 49B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD49B, Length 72 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD49B-201ENST00000365172 TMEM176AQ96HP8 235 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SCYL1Q96KG9 808 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 CCDC74BQ96LY2 380 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 UROC1Q96N76 676 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 GUCD1Q96NT3 240 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 FAM129BQ96TA1 746 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 KIF2CQ99661 725 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SYT17Q9BSW7 474 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 CARD11Q9BXL7 1154 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SLC46A2Q9BY10 475 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 GPR87Q9BY21 358 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 WDR11Q9BZH6 1224 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SEMA4CQ9C0C4 833 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 CEP44Q9C0F1 390 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 PRO3102Q9H379 93 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 FN3KRPQ9HA64 309 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 GP6Q9HCN6 339 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 CCDC87Q9NVE4 849 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 FBXO28Q9NVF7 368 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 GFOD1Q9NXC2 390 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 DLL3Q9NYJ7 618 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 ELOVL5Q9NYP7 299 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 FOXJ2Q9P0K8 574 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 GULP1Q9UBP9 304 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SEPT3Q9UH03 358 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 EGFL7Q9UHF1 273 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 GLS2Q9UI32 602 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 MCM8Q9UJA3 840 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 ZFP69BQ9UJL9 534 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 COG6Q9Y2V7 657 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 NR2E1Q9Y466 385 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 MAST3O60307 1309 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 PRR36Q9H6K5 1346 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 COL18A1P39060 1754 aa0.03□□□□□ -2.4
SNORD49B-201ENST00000365172 APC2O95996 2303 aa0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 IQSEC2Q5JU85 1478 aa0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 MRC2Q9UBG0 1479 aa0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 SHANK2Q9UPX8 1470 aa0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 ZZEF1O43149 2961 aa0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 SVILO95425 2214 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 CADP27708 2225 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 DNAH10Q8IVF4 4471 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 A0A0U1RQV1 116 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 TCRBV5S2A0A599 114 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 GAGE12BA1L429 117 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 C7orf72A4D263 438 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 GAGE12HA6NDE8 117 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 ANTXRLA6NF34 631 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 MYMKA6NI61 221 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 ARID3CA6NKF2 412 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 IFITM10A6NMD0 228 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 ZNF839A8K0R7 811 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 AHRRA9YTQ3 701 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 RNF103O00237 685 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 MAN2B1O00754 1011 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 SOCS2O14508 198 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 RGS13O14921 159 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 AURKAO14965 403 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 GPR182O15218 404 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 GRID2O43424 1007 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 TOM1O60784 492 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 FBXO24O75426 580 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 CLEC3AO75596 197 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 FBXO21O94952 628 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 HTR3BO95264 441 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 TBC1D8O95759 1140 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 IL18BPO95998 194 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 HMGCRP04035 888 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 FUCA1P04066 466 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 SERPINB2P05120 415 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 ALPLP05186 524 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 NEFLP07196 543 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 THBDP07204 575 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 TGFB3P10600 412 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 GYPEP15421 78 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 PDE6AP16499 860 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 LAG3P18627 525 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 PLCG1P19174 1290 aa0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 EN2P19622 333 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms