RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 KRT72Q14CN4 511 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 GPR19Q15760 415 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 INF2Q27J81 1249 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 MIER2Q8N344 545 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 ANKRD42Q8N9B4 389 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 ASIC4Q96FT7 647 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 KCNJ15Q99712 375 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 TMOD3Q9NYL9 352 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 RNF181Q9P0P0 153 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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CCL20-201ENST00000358813 LTN1O94822 1766 aa6.69□□□□□ -1.34
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CCL20-201ENST00000358813 ZBED1O96006 694 aa6.69□□□□□ -1.34
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CCL20-201ENST00000358813 RFC4P35249 363 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 TRAPPC10P48553 1259 aa6.69□□□□□ -1.34
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CCL20-201ENST00000358813 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 JADE3Q92613 823 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 ACSS2Q9NR19 701 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 CLDND1Q9NY35 253 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 RTL1A6NKG5 1358 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 PAX4O43316 350 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 KDM1AO60341 852 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 FKTNO75072 461 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 HRGP04196 525 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 CYP17A1P05093 508 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.68□□□□□ -1.34
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CCL20-201ENST00000358813 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 KRT15P19012 456 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 CD40P25942 277 aa6.68□□□□□ -1.34
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CCL20-201ENST00000358813 JAM2P57087 298 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 TMF1P82094 1093 aa6.68□□□□□ -1.34
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CCL20-201ENST00000358813 STK3Q13188 491 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 RTP2Q5QGT7 225 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 HPS3Q969F9 1004 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 MAP3K14Q99558 947 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 SENP7Q9BQF6 1050 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 SELENOOQ9BVL4 669 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 SP110Q9HB58 689 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.68□□□□□ -1.34
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CCL20-201ENST00000358813 A0A0G2JLW4 131 aa6.67□□□□□ -1.34
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CCL20-201ENST00000358813 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 FAM168AQ92567 244 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 TMEM169Q96HH4 297 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 KIRREL1Q96J84 757 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
CCL20-201ENST00000358813 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.67□□□□□ -1.34
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