RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 SOX5P35711 763 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC7A5Q01650 507 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 SPOPLQ6IQ16 392 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 KSR1Q8IVT5 923 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 ELMOD1Q8N336 334 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 CHST13Q8NET6 341 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 TNIP3Q96KP6 325 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 KATNAL1Q9BW62 490 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 POLIQ9UNA4 740 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 ADGRG1Q9Y653 693 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 RHOBTB3O94955 611 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 GH1P01241 217 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 CAV1Q03135 178 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 NNTQ13423 1086 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM39BQ9GZU3 492 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 TBK1Q9UHD2 729 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 PAMP19021 973 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 ADCY1Q08828 1119 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 ADSSL1Q8N142 457 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 GDAP1Q8TB36 358 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 RAET1EQ8TD07 263 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 VCX3AQ9NNX9 186 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 CASP8Q14790 479 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 RFFLQ8WZ73 363 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 CFAP36Q96G28 342 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 NFU1Q9UMS0 254 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 GYS1P13807 737 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 TAP1Q03518 808 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 PDXDC1Q6P996 788 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 CA4P22748 312 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 RHOT1Q8IXI2 618 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 HEMGNQ9BXL5 484 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 CAPN11Q9UMQ6 739 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 TTI1O43156 1089 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 KLC3Q6P597 504 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 GLYCTKQ8IVS8 523 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 FAN1Q9Y2M0 1017 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 RFC5P40937 340 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 MXRA8Q9BRK3 442 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX24Q9Y343 169 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 PARD3BQ8TEW8 1205 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 HEY1Q9Y5J3 304 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 CCT5P48643 541 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 SATB1Q01826 763 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 TTC25Q96NG3 672 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 REEP2Q9BRK0 252 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 HSPBP1Q9NZL4 362 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 ASAP2O43150 1006 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 BNIP3LO60238 219 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 PLS3P13797 630 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 EDRF1Q3B7T1 1238 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 SCFD2Q8WU76 684 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 ACSL3O95573 720 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 CETPP11597 493 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 CLCN6P51797 869 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 DPYDQ12882 1025 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 EFHC2Q5JST6 749 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 WNT8AQ9H1J5 351 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 SAYSD1Q9NPB0 183 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 ABCB6Q9NP58 842 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 HPCAL4Q9UM19 191 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-201ENST00000344528 NR1D1P20393 614 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 MMP14P50281 582 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAPPC3O43617 180 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 RPA1P27694 616 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 TROAPQ12815 778 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 PCSK1NQ9UHG2 260 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 GRID2IPA4D2P6 1211 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 KRT38O76015 456 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 CHRNA3P32297 505 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 STILQ15468 1287 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 MUM1Q2TAK8 710 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR72Q3MJ13 1102 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf228Q6PIY5 440 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 SDCCAG3Q96C92 435 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBBXA8MT70 800 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 TOM1L1O75674 476 aa17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 121.2 ms