RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.57■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 C4orf19Q8IY42 314 aa23.57■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 KREMEN2Q8NCW0 462 aa23.57■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 PGBD4Q96DM1 585 aa23.57■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 RIPOR3Q96MK2 946 aa23.57■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 LXNQ9BS40 222 aa23.57■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 GBP3Q9H0R5 595 aa23.57■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa23.57■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 RGL1Q9NZL6 768 aa23.57■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 PPME1Q9Y570 386 aa23.57■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 WEE2P0C1S8 567 aa23.56■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 SLC11A1P49279 550 aa23.56■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 EXOC8Q8IYI6 725 aa23.56■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 DNAJB4Q9UDY4 337 aa23.56■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa23.56■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 BTBD18B2RXH4 712 aa23.55■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 EPCAMP16422 314 aa23.55■■□□□ 1.36
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SOCS1-201ENST00000332029 SPIRE1Q08AE8 756 aa23.55■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 MTMR3Q13615 1198 aa23.55■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 TRIM29Q14134 588 aa23.55■■□□□ 1.36
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SOCS1-201ENST00000332029 URGCPQ8TCY9 931 aa23.55■■□□□ 1.36
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SOCS1-201ENST00000332029 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.55■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 SORCS3Q9UPU3 1222 aa23.55■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
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SOCS1-201ENST00000332029 ATAT1Q5SQI0 421 aa23.54■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 KIAA1841Q6NSI8 718 aa23.54■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 KANK3Q6NY19 840 aa23.54■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa23.54■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF280BQ86YH2 543 aa23.54■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 UBALD2Q8IYN6 164 aa23.54■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 SLC22A17Q8WUG5 538 aa23.54■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 VN1R3Q9BXE9 311 aa23.54■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 KMT2EQ8IZD2 1858 aa23.53■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 B4GALT3O60512 393 aa23.53■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 BRD1O95696 1058 aa23.53■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa23.53■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 ST3GAL1Q11201 340 aa23.53■■□□□ 1.36
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SOCS1-201ENST00000332029 CABP7Q86V35 215 aa23.53■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 MINDY3Q9H8M7 445 aa23.53■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 RSAD1Q9HA92 442 aa23.53■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
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SOCS1-201ENST00000332029 SLITRK3O94933 977 aa23.52■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 CYP4A11Q02928 519 aa23.52■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa23.52■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 CALCRLQ16602 461 aa23.52■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 XKR9Q5GH70 373 aa23.52■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 PPFIBP1Q86W92 1011 aa23.52■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 TPH2Q8IWU9 490 aa23.52■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 STK39Q9UEW8 545 aa23.52■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa23.52■■□□□ 1.36
SOCS1-201ENST00000332029 ZBTB39O15060 712 aa23.51■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 GAS2O43903 313 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 DDHD2O94830 711 aa23.51■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 EMC2Q15006 297 aa23.51■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 UBXN11Q5T124 520 aa23.51■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa23.51■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 TCP11Q8WWU5 503 aa23.51■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 KANSL3Q9P2N6 904 aa23.51■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.51■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 WNT7AO00755 349 aa23.5■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 NEMFO60524 1076 aa23.5■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
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SOCS1-201ENST00000332029 C8orf34Q49A92 452 aa23.5■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 TMC5Q6UXY8 1006 aa23.5■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 RNF149Q8NC42 400 aa23.5■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.5■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 TMEM175Q9BSA9 504 aa23.5■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa23.5■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 SMOC2Q9H3U7 446 aa23.5■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 SFXN1Q9H9B4 322 aa23.5■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 USTQ9Y2C2 406 aa23.5■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 SPDYE4A6NLX3 237 aa23.49■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 ASAP2O43150 1006 aa23.49■■□□□ 1.35
SOCS1-201ENST00000332029 POMCP01189 267 aa23.49■■□□□ 1.35
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