RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330149.9

TRAPPC6B-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6B, Length 3,242 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6B-201ENST00000330149 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.3□□□□□ -1.4
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 NSMFQ6X4W1 530 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC6B-201ENST00000330149 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC6B-201ENST00000330149 COPS5Q92905 334 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC6B-201ENST00000330149 PANX2Q96RD6 677 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC6B-201ENST00000330149 SWAP70Q9UH65 585 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC6B-201ENST00000330149 SAMM50Q9Y512 469 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC6B-201ENST00000330149 ZNF292O60281 2723 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC6B-201ENST00000330149 ZBTB43O43298 467 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC6B-201ENST00000330149 ZEB2O60315 1214 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC6B-201ENST00000330149 ZBED4O75132 1171 aa6.3□□□□□ -1.4
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 CXorf56Q9H5V9 222 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC6B-201ENST00000330149 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC6B-201ENST00000330149 RNF146Q9NTX7 359 aa6.3□□□□□ -1.4
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.29□□□□□ -1.4
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 CAPS2Q9BXY5 557 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC6B-201ENST00000330149 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.29□□□□□ -1.4
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 B4E1Z4 1266 aa6.29□□□□□ -1.4
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC6B-201ENST00000330149 TUBB8Q3ZCM7 444 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC6B-201ENST00000330149 GBP6Q6ZN66 633 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC6B-201ENST00000330149 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC6B-201ENST00000330149 BANK1Q8NDB2 785 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC6B-201ENST00000330149 CEP95Q96GE4 821 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC6B-201ENST00000330149 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC6B-201ENST00000330149 MKNK2Q9HBH9 465 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC6B-201ENST00000330149 TAB2Q9NYJ8 693 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC6B-201ENST00000330149 HPSEQ9Y251 543 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC6B-201ENST00000330149 SLC12A7Q9Y666 1083 aa6.29□□□□□ -1.4
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