RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329151.5

TMEM54-201, Transcript of transmembrane protein 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM54, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54-201ENST00000329151 PTPN5P54829 565 aa26.01■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 CYP4A11Q02928 519 aa26.01■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 TRIM29Q14134 588 aa26.01■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 TFDP1Q14186 410 aa26.01■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 ATAT1Q5SQI0 421 aa26.01■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 CABP7Q86V35 215 aa26.01■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 TPH2Q8IWU9 490 aa26.01■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 RNF149Q8NC42 400 aa26.01■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 CNNM3Q8NE01 707 aa26.01■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 AUTS2Q8WXX7 1259 aa26.01■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 DYDC2Q96IM9 177 aa26.01■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa26.01■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 TPCN1Q9ULQ1 816 aa26.01■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 OXER1Q8TDS5 423 aa26■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 UBN1Q9NPG3 1134 aa26■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 RGL1Q9NZL6 768 aa26■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 WDFY4Q6ZS81 3184 aa26■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 ALDH2P05091 517 aa25.99■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 SLC11A1P49279 550 aa25.99■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 ANAPC15P60006 121 aa25.99■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 MTMR3Q13615 1198 aa25.99■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 HACE1Q8IYU2 909 aa25.99■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 HAS1Q92839 578 aa25.99■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 POMKQ9H5K3 350 aa25.99■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 GJB4Q9NTQ9 266 aa25.99■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 DNAJB4Q9UDY4 337 aa25.99■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 FAN1Q9Y2M0 1017 aa25.99■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 IRAK3Q9Y616 596 aa25.99■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 MEIS3P2A8K0S8 358 aa25.98■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 NR1I2O75469 434 aa25.98■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 ITGA4P13612 1032 aa25.98■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 CALCRLQ16602 461 aa25.98■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa25.98■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 FERMT3Q86UX7 667 aa25.98■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 TMEM175Q9BSA9 504 aa25.98■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 PCDHA12Q9UN75 941 aa25.98■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 KLRC2P26717 231 aa25.97■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 AK2P54819 239 aa25.97■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 NOTUMQ6P988 496 aa25.97■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 UBALD2Q8IYN6 164 aa25.97■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 KREMEN2Q8NCW0 462 aa25.97■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 SORCS3Q9UPU3 1222 aa25.97■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa25.96■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 POMCP01189 267 aa25.96■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 WEE2P0C1S8 567 aa25.96■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 EPCAMP16422 314 aa25.96■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 AXLP30530 894 aa25.96■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 NR5A1Q13285 461 aa25.96■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.96■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 KIAA1841Q6NSI8 718 aa25.96■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 AGMOQ6ZNB7 445 aa25.96■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF280BQ86YH2 543 aa25.96■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 PLCD3Q8N3E9 789 aa25.96■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 CCDC51Q96ER9 411 aa25.96■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 MINDY3Q9H8M7 445 aa25.96■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 CDH22Q9UJ99 828 aa25.96■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa25.96■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
TMEM54-201ENST00000329151 C2CD4DB7Z1M9 353 aa25.95■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 DTNBO60941 627 aa25.95■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 URODP06132 367 aa25.95■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa25.95■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 SFXN1Q9H9B4 322 aa25.95■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 KMT2EQ8IZD2 1858 aa25.94■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 NCLP19338 710 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 OR1G1P47890 313 aa25.94■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 PTPN14Q15678 1187 aa25.94■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 TMC5Q6UXY8 1006 aa25.94■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 NECAB1Q8N987 351 aa25.94■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 NEMFO60524 1076 aa25.93■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 DGAT1O75907 488 aa25.93■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 FOSBP53539 338 aa25.93■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 PRSS33Q8NF86 280 aa25.93■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 GTF3C6Q969F1 213 aa25.93■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 APOL6Q9BWW8 343 aa25.93■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 ANKEF1Q9NU02 776 aa25.93■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 DPP7Q9UHL4 492 aa25.93■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 FAM205CA6NFA0 338 aa25.92■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 C2CD2LO14523 706 aa25.92■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 NRP1O14786 923 aa25.92■■□□□ 1.74
TMEM54-201ENST00000329151 DDHD2O94830 711 aa25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms