RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328252.3

PAPPA-201, Transcript of pappalysin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PAPPA, Length 10,959 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-201ENST00000328252 CHUKO15111 745 aa14.71□□□□□ -0.05
PAPPA-201ENST00000328252 HSPA2P54652 639 aa14.71□□□□□ -0.05
PAPPA-201ENST00000328252 KRT31Q15323 416 aa14.71□□□□□ -0.05
PAPPA-201ENST00000328252 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.71□□□□□ -0.05
PAPPA-201ENST00000328252 ABCB6Q9NP58 842 aa14.71□□□□□ -0.05
PAPPA-201ENST00000328252 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PAPPA-201ENST00000328252 NUP93Q8N1F7 819 aa14.71□□□□□ -0.05
PAPPA-201ENST00000328252 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PAPPA-201ENST00000328252 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PAPPA-201ENST00000328252 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.71□□□□□ -0.05
PAPPA-201ENST00000328252 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.71□□□□□ -0.05
PAPPA-201ENST00000328252 YEATS2Q9ULM3 1422 aa14.71□□□□□ -0.05
PAPPA-201ENST00000328252 FGD2Q7Z6J4 655 aa14.71□□□□□ -0.05
PAPPA-201ENST00000328252 MB21D1Q8N884 522 aa14.71□□□□□ -0.05
PAPPA-201ENST00000328252 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.71□□□□□ -0.05
PAPPA-201ENST00000328252 MMP1P03956 469 aa14.71□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 RAD23BP54727 409 aa14.71□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 RAD51Q06609 339 aa14.71□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 TMEM270Q6UE05 265 aa14.71□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 LUZP2Q86TE4 346 aa14.71□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 SH3GL2Q99962 352 aa14.71□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 TRIM62Q9BVG3 475 aa14.71□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 FOPNLQ96NB1 174 aa14.71□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 DEFA1P59665 94 aa14.71□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 DEFA3P59666 94 aa14.71□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 SARM1Q6SZW1 724 aa14.71□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 STAP1Q9ULZ2 295 aa14.71□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 ARFIP2P53365 341 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 RAB14P61106 215 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 CYP27A1Q02318 531 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 RFWD2Q8NHY2 731 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 RMDN1Q96DB5 314 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 BLOC1S6Q9UL45 172 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 LRRC53A6NM62 1247 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 HMOX2P30519 316 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 PHKA2P46019 1235 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 ARL4DP49703 201 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 JAK3P52333 1124 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 CLEC4FQ8N1N0 589 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 C16orf72Q14CZ0 275 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 BEST2Q8NFU1 509 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 TMEM35BQ8NCS4 154 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 ARL8AQ96BM9 186 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 TLR2O60603 784 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 SYTL3Q4VX76 610 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 SUPT3HB4E1H0 165 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 CHL1O00533 1208 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 NCALDP61601 193 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 PODNQ7Z5L7 613 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 COA7Q96BR5 231 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 SESN1Q9Y6P5 492 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.7□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 HIC1Q14526 733 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 EFHC2Q5JST6 749 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 PIGSQ96S52 555 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 C16orf96A6NNT2 1141 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 TBC1D23Q9NUY8 699 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 GPC5P78333 572 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 UBE3CQ15386 1083 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 ZNF568Q3ZCX4 644 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 VSTM4Q8IW00 320 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 TYK2P29597 1187 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 PPP3CCP48454 512 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 GTF2H3Q13889 308 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 GMNCA6NCL1 334 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 ZNF235Q14590 738 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 ETNK1Q9HBU6 452 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 PPP2R2AP63151 447 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 CUL3Q13618 768 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 INPP5DQ92835 1189 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 SDC4P31431 198 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 PMS2P54278 862 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 MAPK6Q16659 721 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 TRADDQ15628 312 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 CEP95Q96GE4 821 aa14.69□□□□□ -0.06
PAPPA-201ENST00000328252 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms