RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 HIC1Q14526 733 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 MAN2A1Q16706 1144 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 LGALS16A8MUM7 142 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 TREHO43280 583 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 EXOC3O60645 756 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 PIGRP01833 764 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 CDC42EP1Q00587 391 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF410Q86VK4 478 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 SPC24Q8NBT2 197 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 SCLT1Q96NL6 688 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 PRKCBP05771 671 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 CASP4P49662 377 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 GPC3P51654 580 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 ACLYP53396 1101 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 NLRP7Q8WX94 980 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A087WZ62 844 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 ADSSP30520 456 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 ZPBP2Q6X784 338 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 VSTM4Q8IW00 320 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 GARTP22102 1010 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 UBXN1Q04323 297 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 VWA3BQ502W6 1294 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 MIIPQ5JXC2 388 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 SESTD1Q86VW0 696 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 TEX33O43247 280 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 NDST4Q9H3R1 872 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 FZD8Q9H461 694 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 BRCA2P51587 3418 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 ACKR2O00590 384 aa22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 EDN1P05305 212 aa22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 TMC6Q7Z403 805 aa22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 KIZQ2M2Z5 673 aa22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 FKBP15Q5T1M5 1219 aa22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 USP20Q9Y2K6 914 aa22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 MAPK13O15264 365 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 ITGA7Q13683 1181 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 PTPN21Q16825 1174 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM187BQ17R55 369 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 NME8Q8N427 588 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 BORCS6Q96GS4 357 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 GRIN2DO15399 1336 aa22.62■■□□□ 1.21
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