RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP12.2□□□□□ -0.466e-6■■□□□ 14.5
PTPRR-201ENST00000283228 GSTA2P09210 222 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 DLATP10515 647 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 VSTM1Q6UX27 236 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 DNAJC10Q8IXB1 793 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 FAM118BQ9BPY3 351 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 CENPKQ9BS16 269 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 EMILIN3Q9NT22 766 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 AIPL1Q9NZN9 384 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 CHKBQ9Y259 395 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 ASB3Q9Y575 518 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 E9PMD0 336 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 CES2O00748 559 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 WFS1O76024 890 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 TJP3O95049 919 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 TDP2O95551 362 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 TSPY3P0CV98 308 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 TSPY8P0CW00 308 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 RARGP13631 454 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 YY1P25490 414 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 EVA1CP58658 441 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 FYB2Q5VWT5 728 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 WDR66Q8TBY9 1149 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 ALG3Q92685 438 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 KRT35Q92764 455 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF333Q96JL9 665 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 FAM161BQ96MY7 647 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 ISCA1Q9BUE6 129 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 FLT1P17948 1338 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 KDM3BQ7LBC6 1761 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 PHF2O75151 1096 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 LMNAP02545 664 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 FOXN2P32314 431 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 MTFR1Q15390 333 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 P3H1Q32P28 736 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 MDH1BQ5I0G3 518 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 CEP70Q8NHQ1 597 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 DYNLL2Q96FJ2 89 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 LRMDAQ9H2I8 198 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 KIAA1024Q9UPX6 916 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF711Q9Y462 761 aa12.2□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 LAD1O00515 517 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 PODXLO00592 558 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 RDH13Q8NBN7 331 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 RAD54LQ92698 747 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGEF26Q96DR7 871 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 THAP2Q9H0W7 228 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 GNA14O95837 355 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 RASA1P20936 1047 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 CHRNA3P32297 505 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 CNPY1Q3B7I2 92 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 FOXB2Q5VYV0 432 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 OR52E8Q6IFG1 317 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 IZUMO2Q6UXV1 221 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC125Q86Z20 511 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM42Q8IWZ5 723 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 CYP4X1Q8N118 509 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 ANKRD35Q8N283 1001 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 RFFLQ8WZ73 363 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 MAGEB18Q96M61 343 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 ETNK2Q9NVF9 386 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 KLRF2D3W0D1 207 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 E7ENQ6 273 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 GNA11P29992 359 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 DCAF12L1Q5VU92 463 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 RNF43Q68DV7 783 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC62Q6P9F0 684 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 BTNL9Q6UXG8 535 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 NSMFQ6X4W1 530 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 PROM2Q8N271 834 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 MTA3Q9BTC8 594 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC27Q9C0I9 530 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 GRHL1Q9NZI5 618 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 ATXN10Q9UBB4 475 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 ALG6Q9Y672 507 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRR-201ENST00000283228 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms