RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000052747.3

Nhlrc1-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, mousemouse

APPRIS P1 BASIC

Gene Nhlrc1, Length 2,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gga2Q6P5E6 603 aa25.17■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Ece2Q80Z60 881 aa25.17■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Slc18a1Q8R090 521 aa25.17■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Vps36Q91XD6 386 aa25.17■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Pcdhb12Q91Y07 789 aa25.17■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 GrapQ9CX99 217 aa25.17■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Tcirg1Q9JHF5 834 aa25.17■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Myh11O08638 1972 aa25.17■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Lrrc74aA0A1Y7VMD6 494 aa25.17■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Ppp1r9aH3BJD6 1292 aa25.17■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 UgcgO88693 394 aa25.17■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Map2k1P31938 393 aa25.17■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Prom2Q3UUY6 835 aa25.17■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Rhox12Q4TU81 186 aa25.17■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 E2f8Q58FA4 860 aa25.17■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Kcnt1Q6ZPR4 1224 aa25.17■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 AarsQ8BGQ7 968 aa25.17■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Slc12a8Q8VI23 705 aa25.17■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Nr3c2Q8VII8 978 aa25.17■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Cpne8Q9DC53 577 aa25.17■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 DgkkE9Q7N4 1118 aa25.16■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Trappc3O55013 180 aa25.16■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Psmd1Q3TXS7 953 aa25.16■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Ctc1Q5SUQ9 1212 aa25.16■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Vav2Q60992 868 aa25.16■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Cplx4Q80WM3 160 aa25.16■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Q8BGC1 442 aa25.16■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Rtp1Q8C8C1 263 aa25.16■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gramd4Q8CB44 633 aa25.16■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Znf830Q8R1N0 363 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Thumpd2Q9CZB3 528 aa25.16■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Atrnl1Q6A051 1378 aa25.16■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Hsf3D0VYS2 492 aa25.16■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Rasal2E9PW37 1286 aa25.16■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 rp9P97762 213 aa25.16■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Erich4Q3UNU4 136 aa25.16■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 4933427I04RikQ3V053 235 aa25.16■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Ccdc92bQ5SUE3 299 aa25.16■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Slc9c1Q6UJY2 1175 aa25.16■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Pop1Q8K205 1045 aa25.16■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 YwhabQ9CQV8 246 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 XdhQ00519 1335 aa25.16■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Smchd1Q6P5D8 2007 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Cfap70D3YVL2 1141 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gm4297D3YWB7 211 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 4930544D05RikJ3QK56 214 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Pdk4O70571 412 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Zcchc2Q69ZB8 1166 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Jade3Q6IE82 823 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Senp6Q6P7W0 1132 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Cypt2Q6P924 180 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Trim37Q6PCX9 961 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Zfp341Q6PGC9 846 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Als2cr12Q8BVM7 383 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Camkk2Q8C078 588 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 BbxQ8VBW5 907 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Kdm4bQ91VY5 1086 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Vmn2r63E9Q0K5 859 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gm9268E9Q0M3 861 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Vmn2r62K7N712 859 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Klc1O88447 541 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Ercc5P35689 1170 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gtf2bP62915 316 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 OgdhQ60597 1023 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Ugt1a9Q62452 528 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Xpnpep1Q6P1B1 623 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Grhl1Q921D9 618 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Q922C1 641 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Med15Q924H2 789 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 MlxiplQ99MZ3 864 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Hdac9Q99N13 588 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Cep19Q9CQA8 163 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Znf704Q9ERQ3 566 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Adam22Q9R1V6 904 aa25.15■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Pex5O09012 639 aa25.14■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Q8BGN9 141 aa25.14■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Kctd6Q8BNL5 237 aa25.14■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Calhm6Q8C9E8 313 aa25.14■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Capn12Q9ER56 720 aa25.14■■□□□ 1.62
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Cfap221A9Q751 836 aa25.14■■□□□ 1.61
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Mdm4O35618 489 aa25.14■■□□□ 1.61
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Irf8P23611 424 aa25.14■■□□□ 1.61
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Ccnd2P30280 289 aa25.14■■□□□ 1.61
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Syt2P46097 422 aa25.14■■□□□ 1.61
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Pon1P52430 355 aa25.14■■□□□ 1.61
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Retreg2Q6NS82 541 aa25.14■■□□□ 1.61
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 CalcbQ99MP3 130 aa25.14■■□□□ 1.61
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 PdhbQ9D051 359 aa25.14■■□□□ 1.61
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Xab2Q9DCD2 855 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Fdxacb1Q3UY23 622 aa25.13■■□□□ 1.61
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 SpdyaQ5IBH7 310 aa25.13■■□□□ 1.61
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Ctnna2Q61301 953 aa25.13■■□□□ 1.61
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Nipa1Q8BHK1 323 aa25.13■■□□□ 1.61
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Lrrc45Q8CIM1 670 aa25.13■■□□□ 1.61
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Lman1Q9D0F3 517 aa25.13■■□□□ 1.61
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Fem1bQ9Z2G0 627 aa25.13■■□□□ 1.61
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Chmp6P0C0A3 200 aa25.12■■□□□ 1.61
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Wfs1P56695 890 aa25.12■■□□□ 1.61
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Cracr2aQ3UP38 310 aa25.12■■□□□ 1.61
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 HnrnpdQ60668 355 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.5 ms