RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Siglec10Q80ZE3 688 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nemp2Q8CB65 421 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 DnerQ8JZM4 737 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slf1Q8R3P9 1054 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc65Q8VHI7 493 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vta1Q9CR26 309 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Grtp1Q9D3N8 359 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dgcr8Q9EQM6 773 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Il21rQ9JHX3 529 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Edf1Q9JMG1 148 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Net1Q9Z206 595 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tbc1d16A2ABG4 766 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mms22lB1AUR6 1238 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tcp10bE9PYJ0 438 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tal1P22091 329 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc8a1P70414 970 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krt15Q61414 452 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Retreg2Q6NS82 541 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nipa1Q8BHK1 323 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Usp20Q8C6M1 916 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tbc1d10cQ8C9V1 444 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Unc5bQ8K1S3 945 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc25a38Q91XD8 326 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam173bQ9D1Z3 247 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PpihQ9D868 188 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem174Q9DCX7 243 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nfs1Q9Z1J3 459 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Thsd7bQ6P4U0 1607 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10110D3Z5M2 615 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Itgb5O70309 798 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tp53P02340 387 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Polr2fP61219 127 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rit2P70425 217 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 YdjcQ14BV6 310 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Senp7Q8BUH8 1037 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cabp5Q9JLK3 173 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mroh9G5E8L9 891 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm4758L7N258 96 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MycnP03966 462 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CalrP14211 416 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Abi2P62484 446 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rps6P62754 249 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 KhsrpQ3U0V1 748 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Muc3aQ3U5A2 218 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ndufaf2Q59J78 168 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Epc2Q8C0I4 808 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Xpo6Q924Z6 1125 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm28036V9GXJ1 658 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kcnu1O54982 1121 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Stk10O55098 966 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 ChkbO55229 394 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AurkbO70126 345 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Serpina1aP07758 413 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MagohP61327 146 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Serpina1cQ00896 412 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Serpina1dQ00897 413 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fdxacb1Q3UY23 622 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ice2Q3UZ18 988 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dhx37Q6NZL1 1150 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PicalmQ7M6Y3 660 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q8BGD0 127 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rab11fip4Q8BQP8 635 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fbxl5Q8C2S5 690 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q8VDP2 222 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Med24Q99K74 987 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MagohbQ9CQL1 146 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lrp2bpQ9D4C6 346 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rasal2E9PW37 1286 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam207aP58468 219 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4933427I04RikQ3V053 235 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rgl2Q61193 778 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krt31Q61765 416 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ddx55Q6ZPL9 600 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SucoQ8C341 1250 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trpm8Q8R4D5 1104 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc35f6Q8VE96 372 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 HlcsQ920N2 722 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rfc4Q99J62 364 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Myl7Q9QVP4 175 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lrrc38A2VDH3 298 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krt8P11679 490 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cst8P32766 142 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Stmn4P63042 189 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lig3P97386 1015 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SpertQ32MG2 446 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 R3hdm2Q80TM6 1044 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Champ1Q8K327 802 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cdca7Q9D0M2 382 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 2310002L09RikQ9D7L5 217 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc91Q9D8L5 442 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fthl17aQ9DAX0 182 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tbx18Q9EPZ6 613 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kcnh7Q9ER47 1195 aa22.27■■□□□ 1.16
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Oip5A2AQ14 241 aa22.26■■□□□ 1.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm2030D3Z7C4 212 aa22.26■■□□□ 1.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hps5P59438 1126 aa22.26■■□□□ 1.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Edem3Q2HXL6 931 aa22.26■■□□□ 1.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Wdr70Q3TWF6 657 aa22.26■■□□□ 1.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf697Q569E7 569 aa22.26■■□□□ 1.15
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P4ha1Q60715 534 aa22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.5 ms