RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tatdn3Q3U1C6 294 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem109Q3UBX0 243 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam92bQ3V2J0 292 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prl2c1Q5SVL9 228 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tcf12Q61286 706 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MsraQ9D6Y7 233 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fgd3O88842 733 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RarbP22605 482 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fgfr4Q03142 799 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mybpc2Q5XKE0 1136 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdc14aQ6GQT0 603 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ano5Q75UR0 904 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pop1Q8K205 1045 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dsg3O35902 993 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sept7O55131 436 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eif3dO70194 548 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ercc5P35689 1170 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rasa2P58069 847 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 InhbaQ04998 424 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc110Q3V125 848 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 F13a1Q8BH61 732 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PdxkQ8K183 312 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MyocdQ8VIM5 935 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smyd3Q9CWR2 428 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prpsap1Q9D0M1 356 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam205a1D3YZF6 1314 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adgrf5G5E8Q8 1348 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Serpinb3aG3X9V8 387 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ifnb1P01575 182 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Taf1bP97358 586 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gba2Q69ZF3 918 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acbd3Q8BMP6 525 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rps6ka5Q8C050 863 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Uba6Q8C7R4 1053 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abhd2Q9QXM0 425 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa13.69□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc6a16A0A1L1SR47 742 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5483B2RV77 97 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp266E9Q2S7 604 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AgtP11859 477 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp9bP98195 1146 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plekha7Q3UIL6 1118 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nuak1Q641K5 658 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spata24Q6P926 205 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rusc1Q8BG26 893 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PolrmtQ8BKF1 1207 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Amz1Q8BVF9 502 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gbp5Q8CFB4 590 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rhobtb2Q91V93 728 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nek8Q91ZR4 698 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Syap1Q9D5V6 365 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pold3Q9EQ28 462 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Morc1Q9WVL5 950 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ptpn23Q6PB44 1692 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spata31E9QAF0 1014 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sox10Q04888 466 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pla2g4cQ64GA5 597 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krt27Q9Z320 448 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snx12O70493 165 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prl2c3P04768 224 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf40Q3U319 1001 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gja3Q64448 417 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sh3tc2Q80VA5 1289 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5622Q810Q0 167 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sept10Q8C650 452 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Taco1Q8K0Z7 294 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Topaz1E5FYH1 1653 aa13.68□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1354E9Q5G9 310 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm3371F7CQW8 167 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Xbp1O35426 267 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nptx2O70340 429 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Siah1aP61092 282 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trim43aQ3TL54 445 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PRAG1Q571I4 1179 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gemin4Q6P6L6 1058 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam102aQ78T81 392 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8BGN9 141 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nop9Q8BMC4 636 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snx10Q9CWT3 201 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arl2bpQ9D385 163 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MefvQ9JJ26 767 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sept6Q9R1T4 434 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Syngap1F6SEU4 1340 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mdm4O35618 489 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Art2bO35975 289 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd86P42082 309 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clcn3P51791 818 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc33Q3ULW6 985 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tp53i13Q5F267 385 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TfrcQ62351 763 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gnl3Q8CI11 538 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9CYI0 393 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp39a1Q9JKJ9 470 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tlr2Q9QUN7 784 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aldh18a1Q9Z110 795 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nup62clA2AG10 272 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TprnA2AI08 749 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sez6lQ6P1D5 963 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HgsQ99LI8 775 aa13.67□□□□□ -0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fmr1P35922 614 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 53.3 ms