RNA–Protein interactions for RNA: YLL013C

PUF3, Transcript of Protein of the mitochondrial outer surface, yeast

Gene PUF3, Length 2,640 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUF3	YLL013C	MRL1	Q06815	381 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	SPO7	P18410	259 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	GIT1	P25346	518 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.06	□□□□□ -1.6	not detected
PUF3	YLL013C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	SPO73	P40031	143 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	VHR1	P40522	640 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	MOB2	P43563	287 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	MRK1	P50873	501 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	YGL101W	P53144	215 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	ASI1	P54074	624 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	ACS1	Q01574	713 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	ABZ2	Q03266	374 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	SSY1	Q03770	852 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	YDR102C	Q03864	110 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	YAP6	Q03935	383 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	UIP4	Q08926	304 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
PUF3	YLL013C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	SIC1	P38634	284 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	CHA4	P43634	648 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	RCE1	Q03530	315 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	BPH1	P25356	2167 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	SNF4	P12904	322 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	ITR1	P30605	584 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	MRPL16	P38064	232 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	SBE22	P38814	852 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	YIL165C	P40446	119 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	AGP3	P43548	558 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	YDR239C	Q03780	787 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	RSM24	Q03976	319 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	API2	Q04413	109 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	not detected
PUF3	YLL013C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	PPA2	P28239	310 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	MRPL6	P32904	214 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	RTC2	P38279	296 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	YBR220C	P38318	560 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	GAT2	P40209	560 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	STB1	P42845	420 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	NUP116	Q02630	1113 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	AGE1	Q04412	482 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	RTN2	Q12443	393 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	NFT1	P0CE68	1218 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	MRPS5	P33759	307 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	RSM22	P36056	628 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	HMS2	P47175	358 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	SIP18	P50263	79 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	ERP6	P53198	216 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	ASI2	P53895	289 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	MIM1	Q08176	113 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	YAK1	P14680	807 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	PTP2	P29461	750 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	PPG1	P32838	368 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	MLH1	P38920	769 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	YER184C	P39961	794 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	FMP33	P46998	180 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	SCY1	P53009	804 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	RRN9	P53437	365 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PUF3	YLL013C	CNA1	P23287	553 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	SED4	P25365	1065 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	DBF20	P32328	564 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	RPC82	P32349	654 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	YER084W	P40057	128 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	DMA2	P53924	522 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	BNA7	Q04066	261 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	LOT6	Q07923	191 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	MSW1	P04803	379 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	CPR2	P23285	205 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	CLB2	P24869	491 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	VPH2	P32341	215 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	YKL187C	P34231	750 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	YTA6	P40328	754 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	MPH1	P40562	993 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	SSY5	P47002	699 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	EXG2	P52911	562 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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