RNA–Protein interactions for RNA: YJL192C

SOP4, Transcript of ER-membrane protein, yeast

Gene SOP4, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOP4	YJL192C	RGT2	Q12300	763 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	VMA9	Q3E7B6	73 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	PCC1	Q3E833	88 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	ISN1	Q99312	450 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	MPD2	Q99316	277 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	TIM9	O74700	87 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	SIR2	P06700	562 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	AQY1	P0CD91	305 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	MER1	P16523	270 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	HOP1	P20050	605 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	POF1	P25576	258 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	ACP1	P32463	125 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	SIP1	P32578	815 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	LOT5	P34234	306 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	ALY1	P36117	915 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	PEX32	P38292	413 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	ALP1	P38971	573 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	HPA3	P39979	161 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	MEP1	P40260	492 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	IME4	P41833	600 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YGR201C	P42936	225 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	PRM10	P42946	383 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	AGX1	P43567	385 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	LOH1	P47055	219 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	TGL2	P54857	326 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	IRC15	Q02733	499 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	TRS31	Q03337	283 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	GOT1	Q03554	138 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	SMA2	Q04658	369 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YLR455W	Q06188	304 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	RIF2	Q06208	395 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YPR091C	Q06833	770 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YLR046C	Q12253	270 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YOL114C	Q12322	202 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	AFI1	Q99222	893 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	AAC1	P04710	309 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	CDC7	P06243	507 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	CBP1	P07252	654 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	ERD2	P18414	219 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	SIR1	P21691	654 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	EPT1	P22140	391 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YCR061W	P25639	631 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YCR099C	P25657	155 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	BUB3	P26449	341 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	CNE1	P27825	502 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	ATP11	P32453	318 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	SCM4	P32564	187 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	SUR1	P33300	382 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	MRPL37	P36532	105 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	POP8	P38208	133 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	VID24	P38263	362 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	LNP1	P38878	278 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	FET3	P38993	636 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	EAF5	P39995	279 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	SLZ1	P40167	298 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YIR035C	P40579	254 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	IDP2	P41939	412 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	GSM1	P42950	618 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	MRX6	P48564	524 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	ATP23	P53722	227 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	CDC14	Q00684	551 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YSA1	Q01976	231 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	CIA1	Q05583	330 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	YLR173W	Q06247	608 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	ANT1	Q06497	328 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	GPN3	Q06543	272 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	ATG41	Q12048	136 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	NUS1	Q12063	375 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	CTF3	Q12748	733 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SOP4	YJL192C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	HAP2	P06774	265 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	CDC23	P16522	626 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	AHC2	P25649	128 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	YUR1	P26725	428 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	DBF20	P32328	564 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SOP4	YJL192C	GSH1	P32477	678 aa		3.52	□□□□□ -1.85

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.7 ms