RNA–Protein interactions for RNA: YJL174W

KRE9, Transcript of Glycoprotein involved in cell wall beta-glucan assembly, yeast

Gene KRE9, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KRE9	YJL174W	PHA2	P32452	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	NUP2	P32499	720 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	NDC1	P32500	655 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	PTR2	P32901	601 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	MIX23	P38162	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	JLP2	P40206	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	MDV1	P47025	714 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	RAD17	P48581	401 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	KRE28	Q04431	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	LOT6	Q07923	191 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	APC9	Q12107	265 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	ZRT1	P32804	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	BIG1	P38813	335 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	YFL040W	P43562	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	PRM6	Q04705	352 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	SET6	Q12529	373 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	CSR2	Q12734	1121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	IZH4	Q99393	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	MHP1	P43638	1398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	PMU1	P36069	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	COX14	P39103	70 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	SLM1	P40485	686 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	YJR030C	P47101	745 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	YMR027W	Q04371	470 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	GIS3	Q12418	502 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	KAR9	P32526	644 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	TRS65	P32893	560 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	YIL169C	P40442	995 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	COA1	P40452	197 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	YIR016W	P40572	265 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	PMT4	P46971	762 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	HCH1	P53834	153 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	BNA7	Q04066	261 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KRE9	YJL174W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	PBN1	P25580	416 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	YKL063C	P35725	167 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	DTR1	P38125	572 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	YBR137W	P38276	179 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	SMF2	P38778	549 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	MTC6	P38849	526 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	EAF6	P47128	113 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	ASR1	Q06834	288 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	PCL9	Q12477	304 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	PPA2	P28239	310 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	RPC37	P36121	282 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	AVT5	P38176	459 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	YBP1	P38315	674 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
KRE9	YJL174W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	GRS2	Q06817	618 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	SMC5	Q08204	1093 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	MSH5	Q12175	901 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	NCB2	Q92317	146 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	CSE1	P33307	960 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	NAT2	P37293	288 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	LDB7	P38210	180 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	RCK2	P38623	610 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	DDI1	P40087	428 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	YIL152W	P40455	235 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	YRB2	P40517	327 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	YGR210C	P42942	411 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	HIT1	P46973	164 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	TIS11	P47977	285 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	SWC4	P53201	476 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	AYT1	Q12226	474 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KRE9	YJL174W	EAF3	Q12432	401 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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