RNA–Protein interactions for RNA: YHR064C

SSZ1, Transcript of Hsp70 protein that interacts with Zuo1p (a DnaJ homolog), yeast

Gene SSZ1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSZ1	YHR064C	KEI1	Q06346	221 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	REX4	Q08237	289 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	RDI1	Q12434	202 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	AAC1	P04710	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	CDC9	P04819	755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PUT1	P09368	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PDE1	P22434	369 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YCR061W	P25639	631 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	ATS1	P31386	333 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PAU2	P32612	120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PXA2	P34230	853 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	ECM15	P35195	104 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	TUL1	P36096	758 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	DTR1	P38125	572 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SDH8	P38345	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YHR122W	P38829	231 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	AIM2	P39721	246 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	HIS6	P40545	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	MNT3	P40549	630 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PHB1	P40961	287 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	RAD17	P48581	401 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PHB2	P50085	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	COS12	P53053	380 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	DOC1	P53068	250 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	FMP48	P53233	369 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PEX30	Q06169	523 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YPR127W	Q06494	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	RSC58	Q07979	502 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SPC3	Q12133	184 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YRM1	Q12340	786 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	ERD1	P16151	362 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	NPR1	P22211	790 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	NAM9	P27929	486 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	NTH1	P32356	751 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	MTH1	P35198	433 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SSO2	P39926	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	BMT5	P40493	336 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PMT6	P42934	759 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YFR020W	P43600	232 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SKP1	P52286	194 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PGA1	P53896	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	INN1	P53901	409 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	ASI3	P53983	676 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	ANT1	Q06497	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	INP53	Q12271	1107 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	TRM13	Q12383	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PRM4	Q12498	284 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	MSB2	P32334	1306 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	HOM3	P10869	527 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	REV1	P12689	985 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	AAC3	P18238	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	MRP17	P28778	131 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	ORC2	P32833	620 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	MAC1	P35192	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SFK1	P35735	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	DOA1	P36037	715 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YKL077W	P36081	392 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	MRPL36	P36531	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	BNA4	P38169	460 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	AZF1	P41696	914 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	CAT5	P41735	233 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	TAD2	P47058	250 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	EMC4	P53073	190 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	FLC3	P53121	802 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	HLR1	Q04429	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	GAS2	Q06135	555 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	XYL2	Q07993	356 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PUS9	Q12069	462 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SUL2	Q12325	893 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SRF1	Q12516	437 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	UIP5	P36137	443 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	RRN10	P38204	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SAF1	P38352	637 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SDP1	P40479	209 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YIL024C	P40543	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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