RNA–Protein interactions for RNA: YGR246C

BRF1, Transcript of TFIIIB B-related factor, yeast

Gene BRF1, Length 1,791 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BRF1	YGR246C	PLB2	Q03674	706 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRF1	YGR246C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BRF1	YGR246C	ATG31	Q12421	196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRF1	YGR246C	FMP16	Q12497	93 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRF1	YGR246C	MTR10	Q99189	972 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BRF1	YGR246C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	RPB5	P20434	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YCR102C	P25608	368 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	HOG1	P32485	435 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	MSN2	P33748	704 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	MRPL3	P36516	390 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	NAT2	P37293	288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	IFA38	P38286	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	TAE1	P38340	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YIL165C	P40446	119 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	CIN1	P40987	1014 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	PMT5	P52867	743 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	EOS1	P53938	366 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	FDH1	Q08911	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	GUP2	Q08929	609 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	SPC3	Q12133	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YOR114W	Q12219	294 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YOR214C	Q12282	236 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	AHC1	Q12433	566 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	ERD1	P16151	362 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	FUN26	P31381	517 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	HMX1	P32339	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	ECT1	P33412	323 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	ECM15	P35195	104 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	OAR1	P35731	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	MIA40	P36046	403 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	PAU24	P38155	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	PHM8	P40025	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	GID8	P40208	455 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	ICE2	P40499	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	APS3	P47064	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	ECM27	P47144	725 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	PAU12	P53343	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	DID2	P69771	204 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	CRT10	Q08226	957 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	HIS3	P06633	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	HIP1	P06775	603 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	STE12	P13574	688 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	CKA1	P15790	372 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	ERD2	P18414	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YCK1	P23291	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YCR100C	P25606	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	RPC34	P32910	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	SLC1	P33333	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	MSS4	P38994	779 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	PLB1	P39105	664 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	BNA6	P43619	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	AAD10	P47182	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	PGA1	P53896	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	NAT4	Q04751	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	SSK1	Q07084	712 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	ATG41	Q12048	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	SKS1	Q12505	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	GCN4	P03069	281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BRF1	YGR246C	SFC1	P33303	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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