RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W IFM1P25038 676 aa11.83□□□□□ -0.52
SSA4YER103W SFK1P35735 353 aa11.83□□□□□ -0.52
SSA4YER103W ARO9P38840 513 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
SSA4YER103W ASP1P38986 381 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
SSA4YER103W YHC3P47040 408 aa11.83□□□□□ -0.52
SSA4YER103W SRB7P47822 140 aa11.83□□□□□ -0.52
SSA4YER103W NUP57P48837 541 aa11.83□□□□□ -0.52
SSA4YER103W MTQ1P53944 314 aa11.83□□□□□ -0.52
SSA4YER103W YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
SSA4YER103W YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
SSA4YER103W YPR145C-AQ2V2P0 78 aa11.83□□□□□ -0.52
SSA4YER103W SOD2P00447 233 aa11.82□□□□□ -0.52
SSA4YER103W HOM3P10869 527 aa11.82□□□□□ -0.52
SSA4YER103W RSC6P25632 483 aa11.82□□□□□ -0.52
SSA4YER103W NTH1P32356 751 aa11.82□□□□□ -0.52
SSA4YER103W PAU2P32612 120 aa11.82□□□□□ -0.52
SSA4YER103W UIP5P36137 443 aa11.82□□□□□ -0.52
SSA4YER103W DED81P38707 554 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
SSA4YER103W RFC2P40348 353 aa11.82□□□□□ -0.52
SSA4YER103W KXD1P53158 218 aa11.82□□□□□ -0.52
SSA4YER103W NRK1P53915 240 aa11.82□□□□□ -0.52
SSA4YER103W LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data11.82□□□□□ -0.52not detected
SSA4YER103W VBA4Q04602 768 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
SSA4YER103W YJR112W-AQ3E743 109 aa11.82□□□□□ -0.52
SSA4YER103W GUT1P32190 709 aa11.82□□□□□ -0.52
SSA4YER103W BAT2P47176 376 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
SSA4YER103W FMP41P53889 259 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
SSA4YER103W KIN28P06242 306 aa11.81□□□□□ -0.52
SSA4YER103W GCD1P09032 578 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
SSA4YER103W TY2A-LR1P0C2J4 438 aa11.81□□□□□ -0.52
SSA4YER103W TY2A-FP0CX61 438 aa11.81□□□□□ -0.52
SSA4YER103W TY2A-GR2P0CX62 438 aa11.81□□□□□ -0.52
SSA4YER103W FUR1P18562 216 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
SSA4YER103W TY2A-CP25383 438 aa11.81□□□□□ -0.52
SSA4YER103W YMC1P32331 307 aa11.81□□□□□ -0.52
SSA4YER103W ARC19P33204 171 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
SSA4YER103W ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data11.81□□□□□ -0.52not detected
SSA4YER103W LYS12P40495 371 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
SSA4YER103W PEX25Q02969 394 aa11.81□□□□□ -0.52
SSA4YER103W TY2A-DR2Q03483 438 aa11.81□□□□□ -0.52
SSA4YER103W YPR114WQ06107 315 aa11.81□□□□□ -0.52
SSA4YER103W TY2A-BQ12260 438 aa11.81□□□□□ -0.52
SSA4YER103W TY2A-OR2Q12293 438 aa11.81□□□□□ -0.52
SSA4YER103W TY2A-DR1Q12392 438 aa11.81□□□□□ -0.52
SSA4YER103W TY2A-OR1Q12439 438 aa11.81□□□□□ -0.52
SSA4YER103W PRM4Q12498 284 aa11.81□□□□□ -0.52
SSA4YER103W TY2A-DR3Q99303 438 aa11.81□□□□□ -0.52
SSA4YER103W YOL163WP0CF20 169 aa11.8□□□□□ -0.52
SSA4YER103W PXA2P34230 853 aa11.8□□□□□ -0.52
SSA4YER103W VPS25P47142 202 aa11.8□□□□□ -0.52
SSA4YER103W CIA1Q05583 330 aa11.8□□□□□ -0.52
SSA4YER103W YLR046CQ12253 270 aa11.8□□□□□ -0.52
SSA4YER103W PHO2P07269 559 aa11.8□□□□□ -0.52
SSA4YER103W SSA3P09435 649 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
SSA4YER103W GLK1P17709 500 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
SSA4YER103W CPR5P35176 225 aa11.8□□□□□ -0.52
SSA4YER103W KAE1P36132 386 aa11.8□□□□□ -0.52
SSA4YER103W ALK1P43633 760 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
SSA4YER103W AIM24P47127 394 aa11.8□□□□□ -0.52
SSA4YER103W ARG5,6Q01217 863 aa11.8□□□□□ -0.52
SSA4YER103W EAF1Q06337 982 aa11.8□□□□□ -0.52
SSA4YER103W YOR387CQ08910 206 aa11.8□□□□□ -0.52
SSA4YER103W TGL5Q12043 749 aa11.8□□□□□ -0.52
SSA4YER103W MRP1P10662 321 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
SSA4YER103W APN1P22936 367 aa11.79□□□□□ -0.52
SSA4YER103W SPS19P32573 292 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
SSA4YER103W TSA1P34760 196 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
SSA4YER103W MRPL37P36532 105 aa11.79□□□□□ -0.52
SSA4YER103W AXL2P38928 823 aa11.79□□□□□ -0.52
SSA4YER103W SLM1P40485 686 aa11.79□□□□□ -0.52
SSA4YER103W DBF20P32328 564 aa11.78□□□□□ -0.52
SSA4YER103W SDP1P40479 209 aa11.78□□□□□ -0.52
SSA4YER103W MRPS18P42847 217 aa11.78□□□□□ -0.52
SSA4YER103W UBX6P47049 396 aa11.78□□□□□ -0.52
SSA4YER103W MNN10P50108 393 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
SSA4YER103W VHT1P53241 593 aa11.78□□□□□ -0.52
SSA4YER103W PEX30Q06169 523 aa11.78□□□□□ -0.52
SSA4YER103W SDO1Q07953 250 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
SSA4YER103W TPO4Q12256 659 aa11.78□□□□□ -0.52
SSA4YER103W ADK1P07170 222 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
SSA4YER103W YOL162WP0CF19 215 aa11.78□□□□□ -0.52
SSA4YER103W APA1P16550 321 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
SSA4YER103W RPD3P32561 433 aa11.78□□□□□ -0.52
SSA4YER103W TCD2P36101 447 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
SSA4YER103W HMT1P38074 348 aa11.78□□□□□ -0.52
SSA4YER103W YHR127WP38833 243 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
SSA4YER103W MXR1P40029 184 aa11.78□□□□□ -0.52
SSA4YER103W PIR1Q03178 341 aa11.78□□□□□ -0.52
SSA4YER103W CDC34P14682 295 aa11.77□□□□□ -0.53
SSA4YER103W GEX1P25596 615 aa11.77□□□□□ -0.53
SSA4YER103W ADE1P27616 306 aa11.77□□□□□ -0.53
SSA4YER103W GEX2P36173 615 aa11.77□□□□□ -0.53
SSA4YER103W DBP8P38719 431 aa11.77□□□□□ -0.53
SSA4YER103W YJR120WP47157 116 aa11.77□□□□□ -0.53
SSA4YER103W BUL1P48524 976 aa11.77□□□□□ -0.53
SSA4YER103W NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
SSA4YER103W MHR1Q06630 226 aa11.77□□□□□ -0.53
SSA4YER103W GPI12P23797 304 aa11.76□□□□□ -0.53
SSA4YER103W BOS1P25385 244 aa11.76□□□□□ -0.53
SSA4YER103W MGR1P25573 417 aa11.76□□□□□ -0.53
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