RNA–Protein interactions for RNA: YDR288W

NSE3, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeast

Gene NSE3, Length 912 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE3	YDR288W	SNX41	Q04053	625 aa		3.49	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	MRX8	Q05473	314 aa		3.49	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	YLR012C	Q07927	99 aa		3.49	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	TIP20	P33891	701 aa		3.48	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	PMT4	P46971	762 aa		3.48	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	FMP48	P53233	369 aa		3.48	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	YGR067C	P53243	804 aa		3.48	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	UBX2	Q04228	584 aa		3.48	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	RRG8	Q06109	277 aa		3.48	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	VAC14	Q06708	880 aa		3.48	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	DSE1	P40077	573 aa		3.47	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	YFL040W	P43562	540 aa		3.47	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	COX16	P47081	118 aa		3.47	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	OKP1	P53298	406 aa		3.47	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	PIN3	Q06449	215 aa		3.47	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		3.47	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	IZH4	Q99393	312 aa		3.47	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	AUS1	Q08409	1394 aa		3.47	□□□□□ -1.85
NSE3	YDR288W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	RPC25	P35718	212 aa		3.46	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	INP2	Q03824	705 aa		3.46	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	YDR018C	Q12185	396 aa		3.46	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	SIA1	Q12212	622 aa		3.46	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	TFC7	Q12415	435 aa		3.46	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	YDL012C	Q12489	107 aa		3.46	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	YOL085C	Q99345	113 aa		3.46	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	DAL80	P26343	269 aa		3.45	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	CYM1	P32898	989 aa		3.45	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	YKL187C	P34231	750 aa		3.45	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	MRPL40	P36534	297 aa		3.45	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	RCK1	P38622	512 aa		3.45	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	PCL7	P40186	285 aa		3.45	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	YIL054W	P40524	105 aa		3.45	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	UFE1	P41834	346 aa		3.45	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	SDS23	P53172	527 aa		3.45	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	YMR244W	Q04018	355 aa		3.45	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	APC4	Q04601	652 aa		3.45	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		3.45	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	CKA2	P19454	339 aa		3.44	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	PET8	P38921	284 aa		3.44	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	SWC4	P53201	476 aa		3.44	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	IES4	Q08561	116 aa		3.44	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	VIK1	Q12045	647 aa		3.44	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	ERP3	Q12403	225 aa		3.44	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	GAL7	P08431	366 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	UGA1	P17649	471 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	ZRT3	P34240	503 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	TDA11	P38854	504 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	FRT2	P39734	528 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	MIC19	P43594	170 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	KEL2	P50090	882 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	YNR066C	P53752	436 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	MIM1	Q08176	113 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	LAG2	Q92325	660 aa		3.43	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	CSM1	P25651	190 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	YGL118C	P53132	145 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	SPO19	Q03029	223 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	YLR413W	Q06689	675 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	APC9	Q12107	265 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.41	□□□□□ -1.86	not detected
NSE3	YDR288W	MCH2	P36032	473 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	BDH1	P39714	382 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	SLM1	P40485	686 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	YIR035C	P40579	254 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	YDL211C	Q12121	372 aa		3.41	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
NSE3	YDR288W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
NSE3	YDR288W	COX10	P21592	462 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NSE3	YDR288W	GPI12	P23797	304 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NSE3	YDR288W	IFM1	P25038	676 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NSE3	YDR288W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
NSE3	YDR288W	RRF1	P38771	230 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NSE3	YDR288W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
NSE3	YDR288W	ASG7	P46993	209 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NSE3	YDR288W	CAX4	P53223	239 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NSE3	YDR288W	BIO4	P53630	237 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NSE3	YDR288W	HST4	P53688	370 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NSE3	YDR288W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
NSE3	YDR288W	GMC1	Q04399	608 aa		3.4	□□□□□ -1.87
NSE3	YDR288W	MRPL6	P32904	214 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NSE3	YDR288W	YKL063C	P35725	167 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NSE3	YDR288W	TRR2	P38816	342 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NSE3	YDR288W	RRG9	P40156	214 aa		3.39	□□□□□ -1.87
NSE3	YDR288W	YLR446W	Q06204	433 aa		3.39	□□□□□ -1.87

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