RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 NPEPPSP55786 919 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 PRKCQQ04759 706 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 STX5Q13190 355 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 SNX30Q5VWJ9 437 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 APOA5Q6Q788 366 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 TBC1D22BQ9NU19 505 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 ERAP1Q9NZ08 941 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 GMEB1Q9Y692 573 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 TTLL1O95922 423 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 IFNAR1P17181 557 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 KRT33BQ14525 404 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 SLC35F6Q8N357 371 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 MCUQ8NE86 351 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 SLCO1B7G3V0H7 640 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 GPC5P78333 572 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 NFIAQ12857 509 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 MESDQ14696 234 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 ABHD8Q96I13 439 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 PCDHA7Q9UN72 937 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 COG2Q14746 738 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF790Q6PG37 636 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 LVRNQ6Q4G3 990 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 CCNYQ8ND76 341 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 SPATA16Q9BXB7 569 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 HOXC6P09630 235 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 TALDO1P37837 337 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 RGS2P41220 211 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 KRT73Q86Y46 540 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 APPL2Q8NEU8 664 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 NAT9Q9BTE0 207 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 FANCLQ9NW38 375 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 TM9SF1O15321 606 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 ICA1Q05084 483 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 DYMQ7RTS9 669 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 NELFCDQ8IXH7 590 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 RUBCNLQ9H714 662 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 KLC4Q9NSK0 619 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 MTMR6Q9Y217 621 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 MYO3BQ8WXR4 1341 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 KLRF2D3W0D1 207 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 MFAP3LO75121 409 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 CARD14Q9BXL6 1004 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 NDST4Q9H3R1 872 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 CFAP43Q8NDM7 1665 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 CFAP99D6REC4 459 aa6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 TGFBR2P37173 567 aa6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 FAM45AQ8TCE6 357 aa6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 PPP2R3CQ969Q6 453 aa6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF560Q96MR9 790 aa6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 COPRSQ9NQ92 184 aa6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 FLT1P17948 1338 aa6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF532Q9HCE3 1301 aa6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 PLEKHG3A1L390 1219 aa6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 PRKAA2P54646 552 aa6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 ITGA9Q13797 1035 aa6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF667Q5HYK9 610 aa6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 PRMT9Q6P2P2 845 aa6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 UNC13DQ70J99 1090 aa6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 SCFD2Q8WU76 684 aa6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM237Q96Q45 408 aa6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 O00370 1275 aa6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 KATNA1O75449 491 aa6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 MYL4P12829 197 aa6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 IFNAR2P48551 515 aa6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.73□□□□□ -1.33
SCN2A-209ENST00000636071 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms