RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589232.5

GTF3C2-AS1-206, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 254 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MCM2P49736 904 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IGBP1P78318 339 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 UBE3AQ05086 875 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ITIH3Q06033 890 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RING1Q06587 406 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 WTAPQ15007 396 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PGM5Q15124 567 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SLC35G1Q2M3R5 365 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 QRICH1Q2TAL8 776 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LONRF3Q496Y0 759 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 VPS53Q5VIR6 699 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CES5AQ6NT32 575 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GIMAP6Q6P9H5 292 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LRSAM1Q6UWE0 723 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RINLQ6ZS11 566 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CYFIP1Q7L576 1253 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TMC7Q7Z402 723 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SLC44A3Q8N4M1 653 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PJA1Q8NG27 643 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TMEM40Q8WWA1 233 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 APPBP2Q92624 585 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NELL1Q92832 810 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CASP10Q92851 521 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MAP4K1Q92918 833 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CASD1Q96PB1 797 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IWS1Q96ST2 819 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PPP1R16BQ96T49 567 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 VN1R3Q9BXE9 311 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ECHDC1Q9NTX5 307 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RTEL1Q9NZ71 1219 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SIT1Q9Y3P8 196 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PCNX2A6NKB5 2137 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SHISA7A6NL88 538 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TTC36A6NLP5 189 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SOBPA7XYQ1 873 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DDX11L8A8MPP1 907 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 C9IYK1 514 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HIP1O00291 1037 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TM4SF5O14894 197 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GIPC1O14908 333 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SGSM2O43147 1006 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 B4GALT3O60512 393 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SNHG28P0DPA3 235 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TOP1P11387 765 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CA8P35219 290 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PI4KAP42356 2102 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SARSP49591 514 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HSD17B4P51659 736 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ARHGAP8P85298 464 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PLCB3Q01970 1234 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LMNB2Q03252 620 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DMWDQ09019 674 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MYBPC2Q14324 1141 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GRIK4Q16099 956 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 XRRA1Q6P2D8 792 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CCDC171Q6TFL3 1326 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KCNT2Q6UVM3 1135 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GPR149Q86SP6 731 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 VSIG10LQ86VR7 867 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ADGRF4Q8IZF3 695 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ABCA7Q8IZY2 2146 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SLC39A11Q8N1S5 342 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KBTBD3Q8NAB2 608 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZBTB44Q8NCP5 570 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NECTIN4Q96NY8 510 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PCYT2Q99447 389 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ADAM2Q99965 735 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 EPC1Q9H2F5 836 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MLXIPQ9HAP2 919 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 VAT1LQ9HCJ6 419 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ANO2Q9NQ90 1003 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 WNT16Q9UBV4 365 aa4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms