RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550724.2

HECTD4-212, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 3

Gene HECTD4, Length 587 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-212ENST00000550724 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
HECTD4-212ENST00000550724 KCNT2Q6UVM3 1135 aa16.09■□□□□ 0.17
HECTD4-212ENST00000550724 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa16.09■□□□□ 0.17
HECTD4-212ENST00000550724 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
HECTD4-212ENST00000550724 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
HECTD4-212ENST00000550724 NACC1Q96RE7 527 aa16.09■□□□□ 0.17
HECTD4-212ENST00000550724 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa16.09■□□□□ 0.17
HECTD4-212ENST00000550724 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa16.09■□□□□ 0.17
HECTD4-212ENST00000550724 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa16.09■□□□□ 0.17
HECTD4-212ENST00000550724 LINC01565O15544 149 aa16.08■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 CA8P35219 290 aa16.08■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 NRIP1P48552 1158 aa16.08■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 PTGDRQ13258 359 aa16.08■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 CAPSQ13938 189 aa16.08■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa16.08■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 GLB1LQ6UWU2 654 aa16.08■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 PGBD4Q96DM1 585 aa16.08■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 CPB2Q96IY4 423 aa16.08■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 GBP3Q9H0R5 595 aa16.08■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 GPRC5CQ9NQ84 441 aa16.08■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 TLR9Q9NR96 1032 aa16.08■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 LRWD1Q9UFC0 647 aa16.08■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa16.08■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 VCANP13611 3396 aa16.07■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 ARHGEF35A5YM69 484 aa16.07■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 MEIS3P2A8K0S8 358 aa16.07■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa16.07■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 PER2O15055 1255 aa16.07■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 NCK2O43639 380 aa16.07■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 IL9P15248 144 aa16.07■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 GLRA2P23416 452 aa16.07■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 ARL2P36404 184 aa16.07■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 NDUFV1P49821 464 aa16.07■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 RAB27AP51159 221 aa16.07■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 ERVFC1P60507 584 aa16.07■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 KRT17Q04695 432 aa16.07■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 UBE3AQ05086 875 aa16.07■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 PLPP4Q5VZY2 271 aa16.07■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 HAUS3Q68CZ6 603 aa16.07■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 C4orf32Q8N8J7 132 aa16.07■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 TLE6Q9H808 572 aa16.07■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa16.07■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 SPG21Q9NZD8 308 aa16.07■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 LRRIQ4A6NIV6 560 aa16.06■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 LIG1P18858 919 aa16.06■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 RPA1P27694 616 aa16.06■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.161e-7■■■■□ 25.3
HECTD4-212ENST00000550724 PTENP60484 403 aa16.06■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 NOMO2Q5JPE7 1267 aa16.06■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 PADI6Q6TGC4 694 aa16.06■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 SNX29Q8TEQ0 813 aa16.06■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 TCF25Q9BQ70 676 aa16.06■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 APOL6Q9BWW8 343 aa16.06■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 KIAA1024Q9UPX6 916 aa16.06■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 REV3LO60673 3130 aa16.05■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa16.05■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 TTC28Q96AY4 2481 aa16.05■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 TSPAN1O60635 241 aa16.05■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 OFD1O75665 1012 aa16.05■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 PPM1AP35813 382 aa16.05■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 BCAR1P56945 870 aa16.05■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 MBTD1Q05BQ5 628 aa16.05■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 ECM1Q16610 540 aa16.05■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 TMEM132AQ24JP5 1023 aa16.05■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 UBXN11Q5T124 520 aa16.05■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 TMC7Q7Z402 723 aa16.05■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 MCPH1Q8NEM0 835 aa16.05■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 URGCPQ8TCY9 931 aa16.05■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 TRAIPQ9BWF2 469 aa16.05■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 RAB34Q9BZG1 259 aa16.05■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 POLD4Q9HCU8 107 aa16.05■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 NLRC5Q86WI3 1866 aa16.05■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 WDR81Q562E7 1941 aa16.04■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 XIRP2A4UGR9 3374 aa16.04■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 GRXCR2A6NFK2 248 aa16.04■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 PP2D1A8MPX8 630 aa16.04■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 B4GALT5O43286 388 aa16.04■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 ZNF623O75123 536 aa16.04■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 ITGA4P13612 1032 aa16.04■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 LTBRP36941 435 aa16.04■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 PLCB3Q01970 1234 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms