RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 DESI2Q9BSY9 194 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MFRPQ9BY79 579 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 POLD4Q9HCU8 107 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 BTBD7Q9P203 1132 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 FBXO40Q9UH90 709 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 BLOC1S6Q9UL45 172 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MYO6Q9UM54 1294 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 SIK3Q9Y2K2 1263 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ASTN1O14525 1302 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 PFASO15067 1338 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 NFASCO94856 1347 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 IQCA1LA6NCM1 817 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 HIP1RO75146 1068 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 RGS20O76081 388 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 FSBPO95073 299 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CCNE2O96020 404 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 KCNA2P16389 499 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 NMT1P30419 496 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 YWHABP31946 246 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 RARRES1P49788 294 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 PSMC5P62195 406 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ETF1P62495 437 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ZBED6P86452 979 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MEA1Q16626 185 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ODR4Q5SWX8 454 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MOB2Q70IA6 237 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ARMC9Q7Z3E5 817 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 TRIM59Q8IWR1 403 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 FAM178BQ8IXR5 827 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ANKRD35Q8N283 1001 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 DNERQ8NFT8 737 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 OPTNQ96CV9 577 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 FIZ1Q96SL8 496 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 IWS1Q96ST2 819 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 SPATC1LQ9H0A9 340 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 BCAS3Q9H6U6 928 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 FAM184BQ9ULE4 1060 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ADGRG1Q9Y653 693 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MYH11P35749 1972 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 PDLIM1O00151 329 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 NR3C1P04150 777 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 RPL13P26373 211 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 GCKP35557 465 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 HERVK_113P62684 666 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MAPK7Q13164 816 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 NFIL3Q16649 462 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 UGCGQ16739 394 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 GNPTABQ3T906 1256 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 TRIM65Q6PJ69 517 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ZNF720Q7Z2F6 126 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 FRMD5Q7Z6J6 570 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MFN1Q8IWA4 741 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 DAW1Q8N136 415 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 RABGGTAQ92696 567 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 TIPINQ9BVW5 301 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ANKEF1Q9NU02 776 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 H3BQF6 201 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 BACH1O14867 736 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 TGFB1I1O43294 461 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 AHCYL1O43865 530 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 PEX10O60683 326 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 USO1O60763 962 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 CNMDO75829 334 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 AKAP3O75969 853 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 TUBBP07437 444 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 EPB41P11171 864 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 ICAM3P32942 547 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 COPB2P35606 906 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 CNTN2Q02246 1040 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 KCNA1Q09470 495 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-204ENST00000546621 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms