RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538886.5

GGA3-202, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 3,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-202ENST00000538886 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
GGA3-202ENST00000538886 TUFT1Q9NNX1 390 aa9.61□□□□□ -0.87
GGA3-202ENST00000538886 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
GGA3-202ENST00000538886 HES2Q9Y543 173 aa9.61□□□□□ -0.87
GGA3-202ENST00000538886 ARAP2Q8WZ64 1704 aa9.61□□□□□ -0.87
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GGA3-202ENST00000538886 A6NJR5 290 aa9.61□□□□□ -0.87
GGA3-202ENST00000538886 KRT13P13646 458 aa9.61□□□□□ -0.87
GGA3-202ENST00000538886 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
GGA3-202ENST00000538886 ZNF484Q5JVG2 852 aa9.61□□□□□ -0.87
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GGA3-202ENST00000538886 RMND1Q9NWS8 449 aa9.61□□□□□ -0.87
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GGA3-202ENST00000538886 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
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GGA3-202ENST00000538886 ADAM2Q99965 735 aa9.6□□□□□ -0.87
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GGA3-202ENST00000538886 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
GGA3-202ENST00000538886 EXOC7Q9UPT5 735 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-202ENST00000538886 CTNND2Q9UQB3 1225 aa9.6□□□□□ -0.87
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GGA3-202ENST00000538886 SLC26A2P50443 739 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-202ENST00000538886 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa9.6□□□□□ -0.87
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GGA3-202ENST00000538886 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-202ENST00000538886 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-202ENST00000538886 EXOC8Q8IYI6 725 aa9.6□□□□□ -0.87
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GGA3-202ENST00000538886 SEPT8Q92599 483 aa9.6□□□□□ -0.87
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GGA3-202ENST00000538886 C4orf19Q8IY42 314 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-202ENST00000538886 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GGA3-202ENST00000538886 PAGE5Q96GU1 130 aa9.59□□□□□ -0.87
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GGA3-202ENST00000538886 DACH1Q9UI36 760 aa9.59□□□□□ -0.87
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GGA3-202ENST00000538886 LPXNO60711 386 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-202ENST00000538886 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
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GGA3-202ENST00000538886 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-202ENST00000538886 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GGA3-202ENST00000538886 TNFRSF25Q93038 417 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-202ENST00000538886 PLCD4Q9BRC7 762 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-202ENST00000538886 FAM213AQ9BRX8 229 aa9.59□□□□□ -0.87
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