RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531933.1

ATG13-218, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 3

Gene ATG13, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-218ENST00000531933 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 MAPK6Q16659 721 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 C1orf186Q6ZWK4 172 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 PDILTQ8N807 584 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 IQUBQ8NA54 791 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 TOP1MTQ969P6 601 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 TIFAQ96CG3 184 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 CCDC51Q96ER9 411 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 RAD9AQ99638 391 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 PBX4Q9BYU1 374 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 TMX1Q9H3N1 280 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 KMT5AQ9NQR1 393 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 CHMP5Q9NZZ3 219 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 PCDHA7Q9UN72 937 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 INSL6Q9Y581 213 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 PTPRSQ13332 1948 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 MYH11P35749 1972 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 MGEA5O60502 916 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 PLS3P13797 630 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 LIG1P18858 919 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 ABCD1P33897 745 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 RABGGTBP53611 331 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 PEX3P56589 373 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 AMPD3Q01432 767 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 MBTD1Q05BQ5 628 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 PPP2R2DQ66LE6 453 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 NOTUMQ6P988 496 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 SHC4Q6S5L8 630 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 HACE1Q8IYU2 909 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 ABI1Q8IZP0 508 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 LINC01599Q8WXQ3 324 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 DHX58Q96C10 678 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 PGBD4Q96DM1 585 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 LRCH3Q96II8 777 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 PRIMPOLQ96LW4 560 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 PANK2Q9BZ23 570 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 ZHX3Q9H4I2 956 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 MAGEF1Q9HAY2 307 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 TMEM161AQ9NX61 479 aa11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 C9IYK1 514 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 K7ERI5 159 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 N4BP3O15049 544 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 TSPAN1O60635 241 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 PRKCBP05771 671 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 CA3P07451 260 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 SCP2P22307 547 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 STRN3Q13033 797 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 DSC3Q14574 896 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 RESP18Q5W5W9 173 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 ADALQ6DHV7 355 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 CEP57L1Q8IYX8 460 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 MYCT1Q8N699 235 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 RNF169Q8NCN4 708 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 CNNM3Q8NE01 707 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 RSPH1Q8WYR4 309 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 BSNDQ8WZ55 320 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 CCDC34Q96HJ3 373 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 REEP2Q9BRK0 252 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 ADPGKQ9BRR6 497 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 TNMDQ9H2S6 317 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 MINDY3Q9H8M7 445 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 PARVGQ9HBI0 331 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 TCHHQ07283 1943 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 TTC3P53804 2025 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 A0A0U1RQF3 1178 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 EOMESO95936 686 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 GAP43P17677 238 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 CMA1P23946 247 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 PBX2P40425 430 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 NPTX2P47972 431 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 MAPK7Q13164 816 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 GIT2Q14161 759 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 FAM187BQ17R55 369 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 TPRNQ4KMQ1 711 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 ARSHQ5FYA8 562 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 DYMQ7RTS9 669 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG13-218ENST00000531933 ECHDC2Q86YB7 292 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms