RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524384.5

PTP4A2-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase type IVA, member 2, human

TSL 5

Gene PTP4A2, Length 663 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTP4A2-208	ENST00000524384	NELL1	Q92832	810 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	CASD1	Q96PB1	797 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	AMN	Q9BXJ7	453 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	BCO2	Q9BYV7	579 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	IRAK3	Q9Y616	596 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	STAM2	O75886	525 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	INSRR	P14616	1297 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	STARD6	P59095	220 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	KCNH2	Q12809	1159 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	VPS52	Q8N1B4	723 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	NXPE3	Q969Y0	559 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	SHD	Q96IW2	340 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	RPS6KA5	O75582	802 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	C1QTNF9	P0C862	333 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	POLR2M	P0CAP2	368 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAM189B	P81408	668 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	GIT2	Q14161	759 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	ABI1	Q8IZP0	508 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZBP1	Q9H171	429 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	RNF19A	Q9NV58	838 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	GINS2	Q9Y248	185 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	MAST4	O15021	2626 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	LAMA4	Q16363	1823 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	GPR182	O15218	404 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	LRP3	O75074	770 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	CTH	P32929	405 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	LPAL2	Q16609	132 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	ODR4	Q5SWX8	454 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	VPS53	Q5VIR6	699 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	DGKH	Q86XP1	1220 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	NME8	Q8N427	588 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZNF511	Q8NB15	262 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	PNMA1	Q8ND90	353 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	STAM	Q92783	540 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	TMEM169	Q96HH4	297 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	GPATCH3	Q96I76	525 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	MYADM	Q96S97	322 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	RAB23	Q9ULC3	237 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	COL4A3	Q01955	1670 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	CLUH	O75153	1309 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	ANHX	E9PGG2	379 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	RET	P07949	1114 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	CTSA	P10619	480 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	CLCN4	P51793	760 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	WTAP	Q15007	396 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	ALX1	Q15699	326 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	CSRP2	Q16527	193 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	TSSK4	Q6SA08	328 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTP4A2-208	ENST00000524384	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91

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