RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513595.1

FOXD1-201, Transcript of forkhead box D1, humanhuman

TSL 3

Gene FOXD1, Length 406 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1-201ENST00000513595 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 TCTN1Q2MV58 587 aa14.79□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 NAALADL2Q58DX5 795 aa14.79□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 FAM117BQ6P1L5 589 aa14.79□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 RPAINQ86UA6 219 aa14.79□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 TET1Q8NFU7 2136 aa14.79□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 PNMA5Q96PV4 448 aa14.79□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.79□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 FUCA2Q9BTY2 467 aa14.79□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 UNC45AQ9H3U1 944 aa14.79□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 TUBE1Q9UJT0 475 aa14.79□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 SPTBN2O15020 2390 aa14.78□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 PTPRSQ13332 1948 aa14.78□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 KPNA6O60684 536 aa14.78□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 CAVIN2O95810 425 aa14.78□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 KCNA2P16389 499 aa14.78□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 GPM6BQ13491 265 aa14.78□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 IKBKEQ14164 716 aa14.78□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 LRRC8DQ7L1W4 858 aa14.78□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 MIER3Q7Z3K6 550 aa14.78□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa14.78□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 SMARCE1Q969G3 411 aa14.78□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.78□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 SIP14410 1827 aa14.78□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 USP24Q9UPU5 2620 aa14.77□□□□□ -0.04
FOXD1-201ENST00000513595 WDR64B1ANS9 1081 aa14.77□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 EML1O00423 815 aa14.77□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 NBNO60934 754 aa14.77□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 TYRO3Q06418 890 aa14.77□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 PNOCQ13519 176 aa14.77□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 NEDD9Q14511 834 aa14.77□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 STX1AQ16623 288 aa14.77□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 PTGISQ16647 500 aa14.77□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 NT5DC1Q5TFE4 455 aa14.77□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 SV2BQ7L1I2 683 aa14.77□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 TRIML1Q8N9V2 468 aa14.77□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 RAD54LQ92698 747 aa14.77□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 CTAGE1Q96RT6 745 aa14.77□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.77□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 ANO10Q9NW15 660 aa14.77□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 PKD2L1Q9P0L9 805 aa14.77□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 CEP250Q9BV73 2442 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 CHMP2AO43633 222 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 ATP9AO75110 1047 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 MED24O75448 989 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 P4HBP07237 508 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 AFMP43652 599 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 RBL2Q08999 1139 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 DPYDQ12882 1025 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 SPATA20Q8TB22 786 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 ASIC4Q96FT7 647 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 GSDMAQ96QA5 445 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 PLIN2Q99541 437 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 SLC9A2Q9UBY0 812 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 DNM3Q9UQ16 869 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 TANC1Q9C0D5 1861 aa14.76□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.75□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 A6NJR5 290 aa14.75□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.75□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 SARSP49591 514 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 CNNM4Q6P4Q7 775 aa14.75□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.75□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 SCFD2Q8WU76 684 aa14.75□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 DYDC2Q96IM9 177 aa14.75□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 C7orf25Q9BPX7 421 aa14.75□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 RMND1Q9NWS8 449 aa14.75□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 SAMM50Q9Y512 469 aa14.75□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 FASNP49327 2511 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 FSD2A1L4K1 749 aa14.74□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 SLITRK3O94933 977 aa14.74□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 LYPLA2O95372 231 aa14.74□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 PSAPP07602 524 aa14.74□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
FOXD1-201ENST00000513595 NLRP12P59046 1061 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms