RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
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SH3BP2-218ENST00000511185 RESTQ13127 1097 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 CAMK1Q14012 370 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 AMHR2Q16671 573 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 UBXN11Q5T124 520 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM173BQ6P4H8 233 aa20.77■□□□□ 0.92
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SH3BP2-218ENST00000511185 CHST12Q9NRB3 414 aa20.77■□□□□ 0.92
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SH3BP2-218ENST00000511185 SNX21Q969T3 373 aa20.75■□□□□ 0.91
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SH3BP2-218ENST00000511185 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
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SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa20.74■□□□□ 0.91
SH3BP2-218ENST00000511185 CLIC4Q9Y696 253 aa20.74■□□□□ 0.91
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SH3BP2-218ENST00000511185 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
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SH3BP2-218ENST00000511185 EYA4O95677 639 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP2-218ENST00000511185 EOMESO95936 686 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP2-218ENST00000511185 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.72■□□□□ 0.91
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SH3BP2-218ENST00000511185 LAG3P18627 525 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP2-218ENST00000511185 POU5F1BQ06416 359 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP2-218ENST00000511185 MAPK7Q13164 816 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPAQ15257 358 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP2-218ENST00000511185 HYIQ5T013 277 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP2-218ENST00000511185 HSCBQ8IWL3 235 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP2-218ENST00000511185 THNSL1Q8IYQ7 743 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP2-218ENST00000511185 DAW1Q8N136 415 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP2-218ENST00000511185 ASB2Q96Q27 587 aa20.71■□□□□ 0.91
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