RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506464.5

ABCC3-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, human

TSL 4

Gene ABCC3, Length 540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC3-208	ENST00000506464	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	RNF19A	Q9NV58	838 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	SPG21	Q9NZD8	308 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	RGL1	Q9NZL6	768 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	CD207	Q9UJ71	328 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	KIF3A	Q9Y496	699 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	FSCN2	O14926	492 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	ALAD	P13716	330 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	IL9	P15248	144 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	FGFR4	P22455	802 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	CYP4A11	Q02928	519 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	COASY	Q13057	564 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	CUL4A	Q13619	759 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	FERMT3	Q86UX7	667 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	RNF169	Q8NCN4	708 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	ERMN	Q8TAM6	284 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	IGFLR1	Q9H665	355 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	TLE6	Q9H808	572 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	STK24	Q9Y6E0	443 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	WNT7A	O00755	349 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	MBTPS2	O43462	519 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	ERLIN2	O94905	339 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	EYA4	O95677	639 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	MUT	P22033	750 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	GJB2	P29033	226 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	IRS1	P35568	1242 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	TXK	P42681	527 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	NRIP1	P48552	1158 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	GIT2	Q14161	759 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	URGCP	Q8TCY9	931 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM143	Q96AN5	459 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	TBX10	O75333	385 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	RARRES1	P49788	294 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	DUSP6	Q16828	381 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	KSR1	Q8IVT5	923 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	HACE1	Q8IYU2	909 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	RNF149	Q8NC42	400 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM169	Q96HH4	297 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	TCF25	Q9BQ70	676 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	MYO7A	Q13402	2215 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	GPR37L1	O60883	481 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	OR52Z1	P0C646	297 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	MCM7	P33993	719 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	BCAR1	P56945	870 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	PTEN	P60484	403 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	ERVFC1	P60507	584 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	ZP2	Q05996	745 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	NOTUM	Q6P988	496 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	TMC7	Q7Z402	723 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	NACC1	Q96RE7	527 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	RAB34	Q9BZG1	259 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	LINC01565	O15544	149 aa		13.59	□□□□□ -0.23

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