RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469025.1

OPTN-209, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 642 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-209ENST00000469025 TDGQ13569 410 aa6.66□□□□□ -1.34
OPTN-209ENST00000469025 CAMK1Q14012 370 aa6.66□□□□□ -1.34
OPTN-209ENST00000469025 UBE4AQ14139 1066 aa6.66□□□□□ -1.34
OPTN-209ENST00000469025 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
OPTN-209ENST00000469025 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
OPTN-209ENST00000469025 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa6.66□□□□□ -1.34
OPTN-209ENST00000469025 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
OPTN-209ENST00000469025 BTBD7Q9P203 1132 aa6.66□□□□□ -1.34
OPTN-209ENST00000469025 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.66□□□□□ -1.34
OPTN-209ENST00000469025 FAM170BA6NMN3 283 aa6.65□□□□□ -1.34
OPTN-209ENST00000469025 SNAP23O00161 211 aa6.65□□□□□ -1.34
OPTN-209ENST00000469025 PRNPP04156 253 aa6.65□□□□□ -1.34
OPTN-209ENST00000469025 CEACAM1P13688 526 aa6.65□□□□□ -1.34
OPTN-209ENST00000469025 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
OPTN-209ENST00000469025 NRIP1P48552 1158 aa6.65□□□□□ -1.34
OPTN-209ENST00000469025 CHRNDQ07001 517 aa6.65□□□□□ -1.34
OPTN-209ENST00000469025 LPAL2Q16609 132 aa6.65□□□□□ -1.34
OPTN-209ENST00000469025 CXCL17Q6UXB2 119 aa6.65□□□□□ -1.34
OPTN-209ENST00000469025 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.65□□□□□ -1.34
OPTN-209ENST00000469025 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
OPTN-209ENST00000469025 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
OPTN-209ENST00000469025 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
OPTN-209ENST00000469025 IL17BQ9UHF5 180 aa6.65□□□□□ -1.34
OPTN-209ENST00000469025 FSD2A1L4K1 749 aa6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 WDR46O15213 610 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 CYP26A1O43174 497 aa6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 CTNNB1P35222 781 aa6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 PLCD1P51178 756 aa6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 CYP27A1Q02318 531 aa6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 GPNMBQ14956 572 aa6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 MCM10Q7L590 875 aa6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 PLBD2Q8NHP8 589 aa6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 NECTIN4Q96NY8 510 aa6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 KRT82Q9NSB4 513 aa6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 MROH5Q6ZUA9 1318 aa6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 CLSPNQ9HAW4 1339 aa6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 ATMQ13315 3056 aa6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 SDK1Q7Z5N4 2213 aa6.64□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 A0A087WV48 116 aa6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 TMPRSS2O15393 492 aa6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 ADCY6O43306 1168 aa6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 PAX4O43316 350 aa6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 ENTPD3O75355 529 aa6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 SVILO95425 2214 aa6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 CXCL10P02778 98 aa6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 LINC00271P0C7V0 271 aa6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 BMPR1AP36894 532 aa6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 CTSWP56202 376 aa6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 DSC3Q14574 896 aa6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 PI16Q6UXB8 463 aa6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 BCO2Q9BYV7 579 aa6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 GREM2Q9H772 168 aa6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 GPR108Q9NPR9 543 aa6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 MIS18AQ9NYP9 233 aa6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 CCDC39Q9UFE4 941 aa6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.63□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 CACNA1EQ15878 2313 aa6.62□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 SPAG17Q6Q759 2223 aa6.62□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 LAMA1P25391 3075 aa6.62□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.62□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.62□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 F5H6K3 240 aa6.62□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 TREHO43280 583 aa6.62□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 SLC28A2O43868 658 aa6.62□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 LIG1P18858 919 aa6.62□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 ERCC3P19447 782 aa6.62□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 MAPK1P28482 360 aa6.62□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 CAP2P40123 477 aa6.62□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 ID3Q02535 119 aa6.62□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.62□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 BFSP2Q13515 415 aa6.62□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 TCTN1Q2MV58 587 aa6.62□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 SYCE2Q6PIF2 218 aa6.62□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.62□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 VN1R2Q8NFZ6 395 aa6.62□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 PJA1Q8NG27 643 aa6.62□□□□□ -1.35
OPTN-209ENST00000469025 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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