RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPN3-209ENST00000466222 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
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CAPN3-209ENST00000466222 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPN3-209ENST00000466222 SETD4Q9NVD3 440 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPN3-209ENST00000466222 USP20Q9Y2K6 914 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPN3-209ENST00000466222 Q9Y3F1 56 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPN3-209ENST00000466222 TISP43B9A030 160 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPN3-209ENST00000466222 TGFB1I1O43294 461 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPN3-209ENST00000466222 PPP1R37O75864 691 aa20.4■□□□□ 0.86
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CAPN3-209ENST00000466222 CPT1AP50416 773 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPN3-209ENST00000466222 CLCN3P51790 818 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPN3-209ENST00000466222 HIC1Q14526 733 aa20.4■□□□□ 0.86
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CAPN3-209ENST00000466222 METTL13Q8N6R0 699 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa20.4■□□□□ 0.86
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CAPN3-209ENST00000466222 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
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CAPN3-209ENST00000466222 KIF20AO95235 890 aa20.39■□□□□ 0.86
CAPN3-209ENST00000466222 C22orf31O95567 290 aa20.39■□□□□ 0.86
CAPN3-209ENST00000466222 GNRH1P01148 92 aa20.39■□□□□ 0.86
CAPN3-209ENST00000466222 INHAP05111 366 aa20.39■□□□□ 0.86
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC175P0C221 793 aa20.39■□□□□ 0.86
CAPN3-209ENST00000466222 RARBP10826 455 aa20.39■□□□□ 0.86
CAPN3-209ENST00000466222 KLRC1P26715 233 aa20.39■□□□□ 0.86
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CAPN3-209ENST00000466222 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa20.39■□□□□ 0.86
CAPN3-209ENST00000466222 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
CAPN3-209ENST00000466222 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.39■□□□□ 0.86
CAPN3-209ENST00000466222 MARCH8Q5T0T0 291 aa20.39■□□□□ 0.86
CAPN3-209ENST00000466222 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 BICDL2A1A5D9 508 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 CLIC2O15247 247 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 MYCP01106 439 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 PPP1R2P41236 205 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 NCKAP1LP55160 1127 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 ADKP55263 362 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 GJA9P57773 515 aa20.39■□□□□ 0.85
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CAPN3-209ENST00000466222 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 KMT5AQ9NQR1 393 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 PPFIA1Q13136 1202 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 CXCL17Q6UXB2 119 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 CNGA4Q8IV77 575 aa20.38■□□□□ 0.85
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CAPN3-209ENST00000466222 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 DENND3A2RUS2 1198 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 ATP8B1O43520 1251 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 ADAMTS4O75173 837 aa20.37■□□□□ 0.85
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CAPN3-209ENST00000466222 GRK4P32298 578 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 GNG11P61952 73 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 TRIM14Q14142 442 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 MFSD10Q14728 455 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 GRIK4Q16099 956 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF484Q5JVG2 852 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 PPP1R16BQ96T49 567 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 MGAMO43451 1857 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 GTF2BQ00403 316 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 LRRC63Q05C16 580 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 CAPSQ13938 189 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 TAS1R3Q7RTX0 852 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 IFT74Q96LB3 600 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 LRRIQ4A6NIV6 560 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 KCNJ18B7U540 433 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 PSEN2P49810 448 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 SMTNP53814 917 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 RTP1P59025 263 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 TUBB2AQ13885 445 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 KCNJ12Q14500 433 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 TCP11X2Q5H9J9 407 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 MTHFD1LQ6UB35 978 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 RHPN2Q8IUC4 686 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 SPIRE2Q8WWL2 714 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 LRRC10BA6NIK2 292 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 HAS3O00219 553 aa20.35■□□□□ 0.85
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