RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463615.1

PDLIM4-205, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

TSL 2

Gene PDLIM4, Length 582 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-205ENST00000463615 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 HELQQ8TDG4 1101 aa22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 TMEM143Q96AN5 459 aa22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 KIF2CQ99661 725 aa22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 TLE6Q9H808 572 aa22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 SPG21Q9NZD8 308 aa22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 ZBTB39O15060 712 aa22.93■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 CSPG5O95196 566 aa22.93■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 NDUFV1P49821 464 aa22.93■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 CYP4A11Q02928 519 aa22.93■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 KCNC3Q14003 757 aa22.93■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 XKR9Q5GH70 373 aa22.93■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.93■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 TPH2Q8IWU9 490 aa22.93■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 RNF169Q8NCN4 708 aa22.93■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.93■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.93■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 ARID2Q68CP9 1835 aa22.92■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 KRT17Q04695 432 aa22.92■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 MTRQ99707 1265 aa22.92■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.92■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.92■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 DGAT1O75907 488 aa22.91■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 TXKP42681 527 aa22.91■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 C8orf34Q49A92 452 aa22.91■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.91■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.91■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.91■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.9■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 ALADP13716 330 aa22.9■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 PTENP60484 403 aa22.9■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 CLUL1Q15846 466 aa22.9■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.9■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 RNF149Q8NC42 400 aa22.9■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.9■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.9■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 PGBD4Q96DM1 585 aa22.9■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 C8orf76Q96K31 380 aa22.9■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 TCF25Q9BQ70 676 aa22.9■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.9■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.9■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.9■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 OFD1O75665 1012 aa22.89■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 ARL2P36404 184 aa22.89■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 PBX3P40426 434 aa22.89■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 RARRES1P49788 294 aa22.89■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 BCAR1P56945 870 aa22.89■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 NOMO2Q5JPE7 1267 aa22.89■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 UBXN11Q5T124 520 aa22.89■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.89■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.88■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 PER2O15055 1255 aa22.88■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.88■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 AXLP30530 894 aa22.88■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 FOSBP53539 338 aa22.88■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 AGMOQ6ZNB7 445 aa22.88■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 CNNM3Q8NE01 707 aa22.88■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 LPPQ93052 612 aa22.88■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 CCDC51Q96ER9 411 aa22.88■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.88■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa22.88■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.87■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 HIDE1A8MVS5 230 aa22.87■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 TRAPPC10P48553 1259 aa22.87■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 TFDP1Q14186 410 aa22.87■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 PLPP4Q5VZY2 271 aa22.87■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 SUSD6Q92537 303 aa22.87■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.87■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 IRAK3Q9Y616 596 aa22.87■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 POTEMA6NI47 508 aa22.86■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 INPPL1O15357 1258 aa22.86■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 DCXO43602 365 aa22.86■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 GALTP07902 379 aa22.86■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.86■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PDLIM4-205ENST00000463615 MCM7P33993 719 aa22.86■■□□□ 1.25
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