RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 FAM105AQ9NUU6 356 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 LZTS1Q9Y250 596 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 BRWD1Q9NSI6 2320 aa14.72□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 A0A087WWV3 80 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 MED24O75448 989 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 RAB27AP51159 221 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 KCNT2Q6UVM3 1135 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 LRRC43Q8N309 656 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 RNF169Q8NCN4 708 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 HELQQ8TDG4 1101 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 NACC1Q96RE7 527 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 NFKBIZQ9BYH8 718 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 CLDND1Q9NY35 253 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 KIF3AQ9Y496 699 aa14.71□□□□□ -0.05
C9orf3-210ENST00000462125 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 OFD1O75665 1012 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 AXLP30530 894 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.067e-6■■■■□ 21.3
C9orf3-210ENST00000462125 ERVFC1P60507 584 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 TFDP1Q14186 410 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 UBXN11Q5T124 520 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 THNSL1Q8IYQ7 743 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 ERMNQ8TAM6 284 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 PGBD4Q96DM1 585 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF558Q96NG5 402 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa14.7□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 FSCN2O14926 492 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 GLRA2P23416 452 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 PPM1AP35813 382 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 PTGDRQ13258 359 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 CAPSQ13938 189 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 EFHBQ8N7U6 833 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 CNNM3Q8NE01 707 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 ASAP3Q8TDY4 903 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 LPPQ93052 612 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 IGFLR1Q9H665 355 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 TLR9Q9NR96 1032 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 SPG21Q9NZD8 308 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 KIAA1671Q9BY89 1806 aa14.69□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 NCOR1O75376 2440 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 CARNS1A5YM72 827 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 MEIS3P2A8K0S8 358 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 LAD1O00515 517 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 LINC01565O15544 149 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 TSPAN1O60635 241 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 IL9P15248 144 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 NCLP19338 710 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 KRT17Q04695 432 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 NBR1Q14596 966 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 AMHR2Q16671 573 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 NOMO2Q5JPE7 1267 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 GLB1LQ6UWU2 654 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 AGMOQ6ZNB7 445 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 CCDC51Q96ER9 411 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 TLE6Q9H808 572 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 STK24Q9Y6E0 443 aa14.68□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 ERLIN2O94905 339 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 CYP11B2P19099 503 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 GJB2P29033 226 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 PRPHP41219 470 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 NRIP1P48552 1158 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 BCAR1P56945 870 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 MBTD1Q05BQ5 628 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 KCNC3Q14003 757 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 ECM1Q16610 540 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 RILPL1Q5EBL4 403 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.67□□□□□ -0.06
C9orf3-210ENST00000462125 POTEGQ6S5H5 508 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.8 ms