RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462123.5

SIKE1-204, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-204ENST00000462123 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF558Q96NG5 402 aa23.22■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 FAM105AQ9NUU6 356 aa23.22■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 POTEMA6NI47 508 aa23.21■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 LAD1O00515 517 aa23.21■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 ARL2P36404 184 aa23.21■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 KCNT2Q6UVM3 1135 aa23.21■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 THNSL1Q8IYQ7 743 aa23.21■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.21■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 TLR9Q9NR96 1032 aa23.21■■□□□ 1.31
SIKE1-204ENST00000462123 GRXCR2A6NFK2 248 aa23.2■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 TECP42680 631 aa23.2■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 KRT17Q04695 432 aa23.2■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 ADAM15Q13444 863 aa23.2■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.2■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 GLB1LQ6UWU2 654 aa23.2■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 EFHBQ8N7U6 833 aa23.2■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.2■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 MCPH1Q8NEM0 835 aa23.2■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 RAB34Q9BZG1 259 aa23.2■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 CLDND1Q9NY35 253 aa23.2■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 SPG21Q9NZD8 308 aa23.2■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 EVPLQ92817 2033 aa23.2■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 LTBRP36941 435 aa23.19■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 RNF169Q8NCN4 708 aa23.19■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.19■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 MINDY3Q9H8M7 445 aa23.19■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 UBN1Q9NPG3 1134 aa23.19■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 PRKAG3Q9UGI9 489 aa23.19■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 REV3LO60673 3130 aa23.19■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa23.18■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 FSCN2O14926 492 aa23.18■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 HELQQ8TDG4 1101 aa23.18■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 KANSL3Q9P2N6 904 aa23.18■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 STK39Q9UEW8 545 aa23.18■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa23.18■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 MED24O75448 989 aa23.17■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 ERLIN2O94905 339 aa23.17■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 IRS1P35568 1242 aa23.17■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 PRPHP41219 470 aa23.17■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 RILPL1Q5EBL4 403 aa23.17■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 NOMO2Q5JPE7 1267 aa23.17■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 FAM178BQ8IXR5 827 aa23.17■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa23.17■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 H3BQ06 376 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 OFD1O75665 1012 aa23.16■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 GLRA2P23416 452 aa23.16■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 CAPSQ13938 189 aa23.16■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 NOTUMQ6P988 496 aa23.16■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.16■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 KCTD17Q8N5Z5 321 aa23.16■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.16■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 HCSTQ9UBK5 93 aa23.16■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 CYP11B2P19099 503 aa23.15■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 PTGDRQ13258 359 aa23.15■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 UBXN11Q5T124 520 aa23.15■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 ASAP3Q8TDY4 903 aa23.15■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 TLE6Q9H808 572 aa23.15■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.15■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 MUC3AQ02505 3323 aa23.15■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 WDR81Q562E7 1941 aa23.14■■□□□ 1.3
SIKE1-204ENST00000462123 INPPL1O15357 1258 aa23.14■■□□□ 1.29
SIKE1-204ENST00000462123 TSPAN1O60635 241 aa23.14■■□□□ 1.29
SIKE1-204ENST00000462123 EYA4O95677 639 aa23.14■■□□□ 1.29
SIKE1-204ENST00000462123 BCAR1P56945 870 aa23.14■■□□□ 1.29
SIKE1-204ENST00000462123 ERVFC1P60507 584 aa23.14■■□□□ 1.29
SIKE1-204ENST00000462123 MBTD1Q05BQ5 628 aa23.14■■□□□ 1.29
SIKE1-204ENST00000462123 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa23.14■■□□□ 1.29
SIKE1-204ENST00000462123 AGMOQ6ZNB7 445 aa23.14■■□□□ 1.29
SIKE1-204ENST00000462123 EP400NLQ6ZTU2 488 aa23.14■■□□□ 1.29
SIKE1-204ENST00000462123 URGCPQ8TCY9 931 aa23.14■■□□□ 1.29
SIKE1-204ENST00000462123 MSLNLQ96KJ4 702 aa23.14■■□□□ 1.29
SIKE1-204ENST00000462123 PRIMPOLQ96LW4 560 aa23.14■■□□□ 1.29
SIKE1-204ENST00000462123 CSRNP2Q9H175 543 aa23.14■■□□□ 1.29
SIKE1-204ENST00000462123 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SIKE1-204ENST00000462123 IGFLR1Q9H665 355 aa23.14■■□□□ 1.29
SIKE1-204ENST00000462123 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
SIKE1-204ENST00000462123 ARHGEF35A5YM69 484 aa23.13■■□□□ 1.29
SIKE1-204ENST00000462123 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa23.13■■□□□ 1.29
SIKE1-204ENST00000462123 USO1O60763 962 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
SIKE1-204ENST00000462123 GJB2P29033 226 aa23.13■■□□□ 1.29
SIKE1-204ENST00000462123 NRIP1P48552 1158 aa23.13■■□□□ 1.29
SIKE1-204ENST00000462123 COASYQ13057 564 aa23.13■■□□□ 1.29
SIKE1-204ENST00000462123 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
SIKE1-204ENST00000462123 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
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