RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 PPP2R5AQ15172 486 aa22.71■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 ECM1Q16610 540 aa22.71■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 CABP7Q86V35 215 aa22.71■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.71■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 AK8Q96MA6 479 aa22.71■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 PLIN2Q99541 437 aa22.71■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.71■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.71■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 FAM105AQ9NUU6 356 aa22.71■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.71■■□□□ 1.23
SCAF8-204ENST00000461219 E9PMD0 336 aa22.7■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 POU5F1BQ06416 359 aa22.7■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 RESTQ13127 1097 aa22.7■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 DEPTORQ8TB45 409 aa22.7■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 PGBD4Q96DM1 585 aa22.7■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 PLVAPQ9BX97 442 aa22.7■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.7■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 MTMR6Q9Y217 621 aa22.7■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 TRANK1O15050 2925 aa22.69■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 LPXNO60711 386 aa22.69■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 CSPG5O95196 566 aa22.69■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 LIG1P18858 919 aa22.69■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 AXLP30530 894 aa22.69■■□□□ 1.22
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SCAF8-204ENST00000461219 NOTUMQ6P988 496 aa22.69■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 LRRC43Q8N309 656 aa22.69■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 HELQQ8TDG4 1101 aa22.69■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 KIFAP3Q92845 792 aa22.69■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 CLIC4Q9Y696 253 aa22.69■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.68■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.68■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 HACE1Q8IYU2 909 aa22.68■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.68■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.67■■□□□ 1.22
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SCAF8-204ENST00000461219 TXLNAP40222 546 aa22.67■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.67■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.67■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.67■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
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SCAF8-204ENST00000461219 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.67■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.67■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 CPB2Q96IY4 423 aa22.67■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
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SCAF8-204ENST00000461219 LPPQ93052 612 aa22.66■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 P2RX5Q93086 422 aa22.66■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC51Q96ER9 411 aa22.66■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 DRC1Q96MC2 740 aa22.66■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 CASD1Q96PB1 797 aa22.66■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.66■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.66■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 THEGQ9P2T0 379 aa22.66■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.66■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 EYSQ5T1H1 3165 aa22.65■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 MAPK6Q16659 721 aa22.65■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
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SCAF8-204ENST00000461219 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.65■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 POLD4Q9HCU8 107 aa22.65■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SCAF8-204ENST00000461219 HIP1RO75146 1068 aa22.64■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 ITGA4P13612 1032 aa22.64■■□□□ 1.21
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SCAF8-204ENST00000461219 STK38Q15208 465 aa22.64■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.64■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 HYIQ5T013 277 aa22.64■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.64■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.64■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.64■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF558Q96NG5 402 aa22.64■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 PNMA5Q96PV4 448 aa22.64■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SCAF8-204ENST00000461219 TIPINQ9BVW5 301 aa22.64■■□□□ 1.21
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