RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 COL19A1Q14993 1142 aa26.34■■□□□ 1.81
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HOXB3-202ENST00000460160 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
HOXB3-202ENST00000460160 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-202ENST00000460160 CAPSQ13938 189 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-202ENST00000460160 LRRC43Q8N309 656 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB3-202ENST00000460160 HELQQ8TDG4 1101 aa26.33■■□□□ 1.81
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HOXB3-202ENST00000460160 GLRA2P23416 452 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 PDIA5Q14554 519 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 ECM1Q16610 540 aa26.32■■□□□ 1.8
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HOXB3-202ENST00000460160 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 IGSF22Q8N9C0 903 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 POF1BQ8WVV4 589 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 LRWD1Q9UFC0 647 aa26.32■■□□□ 1.8
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HOXB3-202ENST00000460160 SKIP12755 728 aa26.31■■□□□ 1.8
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HOXB3-202ENST00000460160 RAB27AP51159 221 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 POU5F1BQ06416 359 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 TFDP1Q14186 410 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 RILPL1Q5EBL4 403 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 LPPQ93052 612 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 GPRC5CQ9NQ84 441 aa26.31■■□□□ 1.8
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HOXB3-202ENST00000460160 IRS1P35568 1242 aa26.3■■□□□ 1.8
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HOXB3-202ENST00000460160 CUL4AQ13619 759 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 IL17AQ16552 155 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 LONRF3Q496Y0 759 aa26.3■■□□□ 1.8
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HOXB3-202ENST00000460160 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 MEIS3P2A8K0S8 358 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 PRPHP41219 470 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 MBTD1Q05BQ5 628 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 HYAL1Q12794 435 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 UBXN11Q5T124 520 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 THNSL1Q8IYQ7 743 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 MCPH1Q8NEM0 835 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 TSPAN1O60635 241 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 UBE3AQ05086 875 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP26.29■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 LEXMQ3ZCV2 418 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 PADI6Q6TGC4 694 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 KCNT2Q6UVM3 1135 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 MAEAQ7L5Y9 396 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
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HOXB3-202ENST00000460160 RAB34Q9BZG1 259 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGEF35A5YM69 484 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa26.28■■□□□ 1.8
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HOXB3-202ENST00000460160 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 PP2D1A8MPX8 630 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 AMHR2Q16671 573 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 CTC1Q2NKJ3 1217 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 SNX29Q8TEQ0 813 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 RSPH1Q8WYR4 309 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF558Q96NG5 402 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 KIAA1024Q9UPX6 916 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXB3-202ENST00000460160 STK24Q9Y6E0 443 aa26.27■■□□□ 1.8
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HOXB3-202ENST00000460160 CYP11B2P19099 503 aa26.26■■□□□ 1.79
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HOXB3-202ENST00000460160 DTHD1Q6ZMT9 781 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-202ENST00000460160 TLR9Q9NR96 1032 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB3-202ENST00000460160 CLDND1Q9NY35 253 aa26.26■■□□□ 1.79
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HOXB3-202ENST00000460160 CDC25AP30304 524 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXB3-202ENST00000460160 AXLP30530 894 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXB3-202ENST00000460160 LTBRP36941 435 aa26.25■■□□□ 1.79
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HOXB3-202ENST00000460160 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
HOXB3-202ENST00000460160 PGBD4Q96DM1 585 aa26.25■■□□□ 1.79
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HOXB3-202ENST00000460160 BHMT2Q9H2M3 363 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXB3-202ENST00000460160 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
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HOXB3-202ENST00000460160 LRRIQ4A6NIV6 560 aa26.24■■□□□ 1.79
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HOXB3-202ENST00000460160 ERVFC1P60507 584 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-202ENST00000460160 NOMO2Q5JPE7 1267 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB3-202ENST00000460160 NOTUMQ6P988 496 aa26.24■■□□□ 1.79
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