RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458646.1

RARB-204, Transcript of retinoic acid receptor beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARB, Length 2,590 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARB-204ENST00000458646 AP3B2Q13367 1082 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 KIF22Q14807 665 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 CNGA2Q16280 664 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 SLC15A2Q16348 729 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 PPP2R5EQ16537 467 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 Q4G0T1 1027 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 BARGINQ6ZT62 677 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 SLC20A1Q8WUM9 679 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 MIEF2Q96C03 454 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 DNAJC18Q9H819 358 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 EBF2Q9HAK2 575 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 GOPCQ9HD26 462 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 PCYOX1Q9UHG3 505 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 DNM3Q9UQ16 869 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 PFASO15067 1338 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 ANKRD62A6NC57 917 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 EML1O00423 815 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 TBX3O15119 743 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 RIPK2O43353 540 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 ALADP13716 330 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 EZRP15311 586 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 NMT1P30419 496 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 SREBF1P36956 1147 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 ADCY2Q08462 1091 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 RIPK1Q13546 671 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 AUHQ13825 339 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 PPP1R7Q15435 360 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 MFSD5Q6N075 450 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 CPNE8Q86YQ8 564 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 ZSWIM1Q9BR11 485 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 VEZTQ9HBM0 779 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 USP40Q9NVE5 1235 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 APEX2Q9UBZ4 518 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 SERPINB13Q9UIV8 391 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 MYH11P35749 1972 aa7.13□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 SMCHD1A6NHR9 2005 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 TLDC2A0PJX2 215 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 MSH4O15457 936 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 SNX3O60493 162 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 RTN2O75298 545 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 TBCAO75347 108 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 UBOX5O94941 541 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 EYA4O95677 639 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 RARAP10276 462 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 KRT13P13646 458 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 CHRNA3P32297 505 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 SLCO1A2P46721 670 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 IFNAR2P48551 515 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 KCNJ2P63252 427 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 TCEAL1Q15170 157 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 CYP1B1Q16678 543 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 GALNTL6Q49A17 601 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 CRY2Q49AN0 593 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 CCDC38Q502W7 563 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 RINT1Q6NUQ1 792 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 BTNL9Q6UXG8 535 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 KSR1Q8IVT5 923 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 CCDC63Q8NA47 563 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 ERMNQ8TAM6 284 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 LMO3Q8TAP4 145 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 CD101Q93033 1021 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 FAXDC2Q96IV6 333 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 DMAC2Q9NW81 257 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 ALG6Q9Y672 507 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 SFI1A8K8P3 1242 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 LRRN2O75325 713 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 PEX5P50542 639 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 MYL7Q01449 175 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 VSTM1Q6UX27 236 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 SLC30A10Q6XR72 485 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 SLF2Q8IX21 1173 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 CERS5Q8N5B7 392 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 CNBD1Q8NA66 436 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 CYP2W1Q8TAV3 490 aa7.12□□□□□ -1.27
RARB-204ENST00000458646 TCP11Q8WWU5 503 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms