RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445181.5

C9orf3-207, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 873 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-207ENST00000445181 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
C9orf3-207ENST00000445181 CLIC6Q96NY7 704 aa26.54■■□□□ 1.84
C9orf3-207ENST00000445181 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
C9orf3-207ENST00000445181 SPTLC2O15270 562 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf3-207ENST00000445181 TXLNAP40222 546 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf3-207ENST00000445181 TFF2Q03403 129 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf3-207ENST00000445181 KARSQ15046 597 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
C9orf3-207ENST00000445181 TMEM119Q4V9L6 283 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf3-207ENST00000445181 LINC00301Q8NCQ3 95 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf3-207ENST00000445181 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
C9orf3-207ENST00000445181 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf3-207ENST00000445181 TTC3P53804 2025 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf3-207ENST00000445181 LRRIQ4A6NIV6 560 aa26.52■■□□□ 1.84
C9orf3-207ENST00000445181 BRD1O95696 1058 aa26.52■■□□□ 1.84
C9orf3-207ENST00000445181 PTENP60484 403 aa26.52■■□□□ 1.84
C9orf3-207ENST00000445181 DSC3Q14574 896 aa26.52■■□□□ 1.84
C9orf3-207ENST00000445181 EPSTI1Q96J88 318 aa26.52■■□□□ 1.84
C9orf3-207ENST00000445181 MINDY3Q9H8M7 445 aa26.52■■□□□ 1.84
C9orf3-207ENST00000445181 CHST12Q9NRB3 414 aa26.52■■□□□ 1.84
C9orf3-207ENST00000445181 DACT1Q9NYF0 836 aa26.52■■□□□ 1.84
C9orf3-207ENST00000445181 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
C9orf3-207ENST00000445181 COL4A6Q14031 1691 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 ERLIN2O94905 339 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 YEATS4O95619 227 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 PLA2G4BP0C869 781 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 POU5F1BQ06416 359 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 GPM6BQ13491 265 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 AAK1Q2M2I8 961 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 RINT1Q6NUQ1 792 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 KIFAP3Q92845 792 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 IFT74Q96LB3 600 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 RUSC1Q9BVN2 902 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 CCSER1Q9C0I3 900 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 POLD4Q9HCU8 107 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 CCDC39Q9UFE4 941 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 CFAP45Q9UL16 551 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 COG5Q9UP83 839 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 C9IYK1 514 aa26.5■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 H3BNC9 293 aa26.5■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 DGKIO75912 1065 aa26.5■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 PLCG1P19174 1290 aa26.5■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 ATL3Q6DD88 541 aa26.5■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 REV3LO60673 3130 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 PPP6R2O75170 966 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 CTNNB1P35222 781 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 PPP2R5AQ15172 486 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 PTPROQ16827 1216 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 USP49Q70CQ1 688 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 CRIPAKQ8N1N5 446 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 HLA-CQ95604 372 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 NFKBIZQ9BYH8 718 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 HIP1RO75146 1068 aa26.48■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 BMPR1AP36894 532 aa26.48■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 C1orf186Q6ZWK4 172 aa26.48■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 RNF169Q8NCN4 708 aa26.48■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 DEPTORQ8TB45 409 aa26.48■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 KCNG4Q8TDN1 519 aa26.48■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 BSNDQ8WZ55 320 aa26.48■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 DRC1Q96MC2 740 aa26.48■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 TMEM161AQ9NX61 479 aa26.48■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 ZDHHC9Q9Y397 364 aa26.48■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 LINC00271P0C7V0 271 aa26.47■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 NCLP19338 710 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 NAMPTP43490 491 aa26.47■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 SLC12A3P55017 1021 aa26.47■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 FAM189BP81408 668 aa26.47■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 MBTD1Q05BQ5 628 aa26.47■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa26.47■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa26.47■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 RAD54LQ92698 747 aa26.47■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 TIPINQ9BVW5 301 aa26.47■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 C2orf40Q9H1Z8 148 aa26.47■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 KCND2Q9NZV8 630 aa26.47■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 RWDD3Q9Y3V2 267 aa26.47■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa26.47■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 RB1P06400 928 aa26.46■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 BMP1P13497 986 aa26.46■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 GUCY2CP25092 1073 aa26.46■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 RRAGBQ5VZM2 374 aa26.46■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 ECHDC2Q86YB7 292 aa26.46■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
C9orf3-207ENST00000445181 A0A0U1RQF3 1178 aa26.45■■□□□ 1.82
C9orf3-207ENST00000445181 CCDC169A6NNP5 214 aa26.45■■□□□ 1.82
C9orf3-207ENST00000445181 C5orf67F2Z3F1 127 aa26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms