RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 PGK2P07205 417 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 PLTPP55058 493 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 PPP1R7Q15435 360 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 THNSL1Q8IYQ7 743 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 NLRP4Q96MN2 994 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 TLR10Q9BXR5 811 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 KLHL11Q9NVR0 708 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 TRPC6Q9Y210 931 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 CSADQ9Y600 493 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 LRP5O75197 1615 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 ERLIN2O94905 339 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 KIF4AO95239 1232 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 ITGA4P13612 1032 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 MEA1Q16626 185 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 Q4G0T1 1027 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 NAGPAQ9UK23 515 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 ICAM1P05362 532 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 FERP16591 822 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR44Q5JSH3 913 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 SULF1Q8IWU6 871 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 THAP2Q9H0W7 228 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR64B1ANS9 1081 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 TGFB1I1O43294 461 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 OTUD6AQ7L8S5 288 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC35G2Q8TBE7 412 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 ADAM33Q9BZ11 813 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 SNX24Q9Y343 169 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 DDNO94850 711 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 GCKP35557 465 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 BFSP1Q12934 665 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 ZBTB10Q96DT7 871 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 SYNCQ9H7C4 482 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 KCND1Q9NSA2 647 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 MYH1P12882 1939 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 PSMD10O75832 226 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 GNGT1P63211 74 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRC71Q8N4P6 559 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 TBX3O15119 743 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 GLI1P08151 1106 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 CCND2P30279 289 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 MFSD4BQ5TF39 518 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 GSTA5Q7RTV2 222 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIM50Q86XT4 487 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 PALB2Q86YC2 1186 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF280CQ8ND82 737 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 SPIRE2Q8WWL2 714 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 HAUS1Q96CS2 278 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 TUFT1Q9NNX1 390 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1B0GUL6 1792 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 DAPK3O43293 454 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 SOX5P35711 763 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 PIK3CAP42336 1068 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 TRPM4Q8TD43 1214 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 AS3MTQ9HBK9 375 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 RNF19AQ9NV58 838 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 PIK3R2O00459 728 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 RAD51CO43502 376 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 PDCLQ13371 301 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 GNPTABQ3T906 1256 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 CPA5Q8WXQ8 436 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 L1RE1Q9UN81 338 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 SGPL1O95470 568 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM153BP0C7A2 387 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 KCNJ1P48048 391 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 PAK2Q13177 524 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM153CQ494X1 144 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 MCTP2Q6DN12 878 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGEF1-210ENST00000437078 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms