RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 FGFR1P11362 822 aa19.96■□□□□ 0.79
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HERC3-205ENST00000426683 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP19.96■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 RNF169Q8NCN4 708 aa19.96■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 LINC00301Q8NCQ3 95 aa19.96■□□□□ 0.79
HERC3-205ENST00000426683 KIFAP3Q92845 792 aa19.96■□□□□ 0.79
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HERC3-205ENST00000426683 EPC2Q52LR7 807 aa19.95■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 C1orf186Q6ZWK4 172 aa19.95■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 USP49Q70CQ1 688 aa19.95■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa19.95■□□□□ 0.78
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HERC3-205ENST00000426683 IFT74Q96LB3 600 aa19.95■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 TRAIPQ9BWF2 469 aa19.95■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 FAM105AQ9NUU6 356 aa19.95■□□□□ 0.78
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HERC3-205ENST00000426683 EOMESO95936 686 aa19.94■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 SKIP12755 728 aa19.94■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 SLC12A3P55017 1021 aa19.94■□□□□ 0.78
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HERC3-205ENST00000426683 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 FBXO22Q8NEZ5 403 aa19.94■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 GDPD5Q8WTR4 605 aa19.94■□□□□ 0.78
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HERC3-205ENST00000426683 BRD1O95696 1058 aa19.93■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 LINC00271P0C7V0 271 aa19.93■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 GUCY2CP25092 1073 aa19.93■□□□□ 0.78
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HERC3-205ENST00000426683 RAB27AP51159 221 aa19.93■□□□□ 0.78
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HERC3-205ENST00000426683 TMEM117Q9H0C3 514 aa19.93■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa19.93■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 RNF19AQ9NV58 838 aa19.93■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 CCDC39Q9UFE4 941 aa19.93■□□□□ 0.78
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HERC3-205ENST00000426683 CHD9Q3L8U1 2897 aa19.92■□□□□ 0.78
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HERC3-205ENST00000426683 PEX3P56589 373 aa19.92■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa19.92■□□□□ 0.78
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HERC3-205ENST00000426683 ZDHHC9Q9Y397 364 aa19.92■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa19.92■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa19.91■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 CCDC169A6NNP5 214 aa19.91■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 SFI1A8K8P3 1242 aa19.91■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 ZNF623O75123 536 aa19.91■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 LIG1P18858 919 aa19.91■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 BMPR1AP36894 532 aa19.91■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 MCM6Q14566 821 aa19.91■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 MAPK6Q16659 721 aa19.91■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 CLLU1OSQ5K130 101 aa19.91■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 ATL3Q6DD88 541 aa19.91■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa19.91■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 GPBP1Q86WP2 473 aa19.91■□□□□ 0.78
HERC3-205ENST00000426683 HELQQ8TDG4 1101 aa19.91■□□□□ 0.78
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