RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 LGALS16A8MUM7 142 aa22.09■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 RARBP10826 455 aa22.09■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 ADSSP30520 456 aa22.09■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 PBX1P40424 430 aa22.09■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.09■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.09■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 LINC01465Q8N7H1 131 aa22.09■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 RNF149Q8NC42 400 aa22.09■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 TCP11Q8WWU5 503 aa22.09■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 DMAC2Q9NW81 257 aa22.09■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 COL1A2P08123 1366 aa22.09■■□□□ 1.13
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ODC1-202ENST00000405333 PSEN2P49810 448 aa22.08■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 UBXN1Q04323 297 aa22.08■■□□□ 1.13
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ODC1-202ENST00000405333 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.08■■□□□ 1.13
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ODC1-202ENST00000405333 NLRP4Q96MN2 994 aa22.08■■□□□ 1.13
ODC1-202ENST00000405333 HAS3O00219 553 aa22.08■■□□□ 1.12
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ODC1-202ENST00000405333 VTNP04004 478 aa22.08■■□□□ 1.12
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ODC1-202ENST00000405333 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.08■■□□□ 1.12
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ODC1-202ENST00000405333 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.08■■□□□ 1.12
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ODC1-202ENST00000405333 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.08■■□□□ 1.12
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ODC1-202ENST00000405333 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 NFIL3Q16649 462 aa22.07■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.07■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.07■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 RDH13Q8NBN7 331 aa22.07■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 RETREG2Q8NC44 543 aa22.07■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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ODC1-202ENST00000405333 MAN2A1Q16706 1144 aa22.06■■□□□ 1.12
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ODC1-202ENST00000405333 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.06■■□□□ 1.12
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ODC1-202ENST00000405333 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.05■■□□□ 1.12
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ODC1-202ENST00000405333 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.05■■□□□ 1.12
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ODC1-202ENST00000405333 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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ODC1-202ENST00000405333 H0YCG3 227 aa22.04■■□□□ 1.12
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ODC1-202ENST00000405333 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
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ODC1-202ENST00000405333 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
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