RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 GNGT1P63211 74 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 PLS1Q14651 629 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 RHOT2Q8IXI1 618 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 OSGEPQ9NPF4 335 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 EMSYQ7Z589 1322 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-202ENST00000399409 PMM2O15305 246 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 TCEAL1Q15170 157 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 TRADDQ15628 312 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 KDM7AQ6ZMT4 941 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 XXYLT1Q8NBI6 393 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 RDH13Q8NBN7 331 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 TRERF1Q96PN7 1200 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 STK32BQ9NY57 414 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 PNMA2Q9UL42 364 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 NFIBO00712 420 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 KRT14P02533 472 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 ECHS1P30084 290 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 PTPROQ16827 1216 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 IL31RAQ8NI17 732 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 CARD9Q9H257 536 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 USP20Q9Y2K6 914 aa25.01■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 GTF2BQ00403 316 aa25■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 EPC2Q52LR7 807 aa25■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNRF3Q9ULT6 936 aa25■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 SAMM50Q9Y512 469 aa25■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 PFASO15067 1338 aa25■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 ABCB4P21439 1286 aa25■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 SEC14L1Q92503 715 aa25■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM114A2Q9NRY5 505 aa25■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 LCMT1Q9UIC8 334 aa25■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 PLAAQ9Y263 795 aa25■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 GRIN2DO15399 1336 aa24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 MTMR1Q13613 665 aa24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 MTMR3Q13615 1198 aa24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 MAEAQ7L5Y9 396 aa24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 PCIF1Q9H4Z3 704 aa24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 GINM1Q9NU53 330 aa24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 HSPBP1Q9NZL4 362 aa24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 ITGA4P13612 1032 aa24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 HAUS6Q7Z4H7 955 aa24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 C4orf19Q8IY42 314 aa24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM107BQ9H098 131 aa24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 GOLGA6L10A6NI86 522 aa24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 YWHABP31946 246 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 DLG4P78352 724 aa24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 PPP3CAQ08209 521 aa24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 NIM1KQ8IY84 436 aa24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 ARHGEF26Q96DR7 871 aa24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 THAP2Q9H0W7 228 aa24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 COL4A5P29400 1685 aa24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 FGGP02679 453 aa24.97■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 ALAS1P13196 640 aa24.97■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 JAK3P52333 1124 aa24.97■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 C11orf63Q6NUN7 778 aa24.97■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa24.97■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 AMACRQ9UHK6 382 aa24.97■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 LRRN2O75325 713 aa24.97■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 HSD17B3P37058 310 aa24.97■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 NCKAP1LP55160 1127 aa24.97■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 CBWD1Q9BRT8 395 aa24.97■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 TAS2R14Q9NYV8 317 aa24.97■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 EXOC7Q9UPT5 735 aa24.97■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa24.96■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 PHF20L1A8MW92 1017 aa24.96■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 PSMC5P62195 406 aa24.96■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 ARHGEF19Q8IW93 802 aa24.96■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 TMBIM4Q9HC24 238 aa24.96■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 ANKEF1Q9NU02 776 aa24.96■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 SFNP31947 248 aa24.96■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 PTENP60484 403 aa24.96■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 C1orf220Q5T0J3 134 aa24.96■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 KCTD16Q68DU8 428 aa24.96■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 SH2D3CQ8N5H7 860 aa24.96■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 HVCN1Q96D96 273 aa24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms