RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391058.1

RNU6-1177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ANKRD34BA5PLL1 514 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MARCH11A6NNE9 402 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FAM90A27PA6NNH2 459 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LEFTY2O00292 366 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NOP56O00567 594 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 BRINP1O60477 761 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MPIG6BO95866 241 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 WT1P19544 449 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 AOAHP28039 575 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ECI1P42126 302 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RHDQ02161 417 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SPIRE1Q08AE8 756 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SPIDRQ14159 915 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DDB1Q16531 1140 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PRSS53Q2L4Q9 553 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 BTBD8Q5XKL5 378 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DENND5AQ6IQ26 1287 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NEK8Q86SG6 692 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KRT73Q86Y46 540 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 OR52N2Q8NGI0 321 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 WDR48Q8TAF3 677 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ACTRT2Q8TDY3 377 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NSMCE1Q8WV22 266 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LYZL4Q96KX0 146 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LGR4Q9BXB1 951 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CD244Q9BZW8 370 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SMURF1Q9HCE7 757 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TMEM260Q9NX78 707 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 BTBD7Q9P203 1132 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LRIT1Q9P2V4 623 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 USTQ9Y2C2 406 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LINC01548A6NM66 108 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DIRC3C9JPN6 131 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MSCO60682 206 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TOX4O94842 621 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CGAP01215 116 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ALPLP05186 524 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HLA-DOAP06340 250 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 VSIG10L2P0DP72 767 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GNAT1P11488 350 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GPD1P21695 349 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 EPHB2P29323 1055 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HOXC12P31275 282 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RESTQ13127 1097 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PSMD2Q13200 908 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GRM1Q13255 1194 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SEMA3AQ14563 771 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SF1Q15637 639 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FAM214AQ32MH5 1076 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FCRLBQ6BAA4 426 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GPR149Q86SP6 731 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RFX6Q8HWS3 928 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CMTM4Q8IZR5 234 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC7A14Q8TBB6 771 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SH3RF2Q8TEC5 729 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 BTN2A2Q8WVV5 523 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HEPHQ9BQS7 1158 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PDCD2LQ9BRP1 358 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NT5C1AQ9BXI3 368 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SEMA4CQ9C0C4 833 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CPNE5Q9HCH3 593 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RIC8BQ9NVN3 520 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NCDNQ9UBB6 729 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PARP2Q9UGN5 583 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TBX1O43435 398 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SPRY2O43597 315 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TBC1D4O60343 1298 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MAFO75444 373 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CDKL5O76039 1030 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LATS1O95835 1130 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CPP00450 1065 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FOSP01100 380 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IGKV3-20P01619 116 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 JUNP05412 331 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CD1AP06126 327 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GRK2P25098 689 aa0.73□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms