RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa27.32■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa27.32■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 FAM187AA6NFU0 413 aa27.31■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 CCDC169A6NNP5 214 aa27.31■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 CCDC50Q8IVM0 306 aa27.31■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 MYCT1Q8N699 235 aa27.31■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 CCDC63Q8NA47 563 aa27.31■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 MAGEC3Q8TD91 643 aa27.31■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 P3H4Q92791 437 aa27.31■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 VAV3Q9UKW4 847 aa27.31■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 PTPN22Q9Y2R2 807 aa27.31■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 L3MBTL1Q9Y468 752 aa27.31■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 KCNJ1P48048 391 aa27.31■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 SPDYCQ5MJ68 293 aa27.31■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 MGARPQ8TDB4 240 aa27.31■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa27.31■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 EZRP15311 586 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 SCNN1DP51172 638 aa27.3■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 FAM182BQ5T319 152 aa27.3■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 ANKS4BQ8N8V4 417 aa27.3■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 CNBD1Q8NA66 436 aa27.3■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP27.3■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 FRMPD4Q14CM0 1322 aa27.3■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 KCNJ2P63252 427 aa27.3■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 OTUD6AQ7L8S5 288 aa27.3■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 MLXIPLQ9NP71 852 aa27.3■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 RIMBP2O15034 1052 aa27.29■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 PHF2O75151 1096 aa27.29■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 PSEN1P49768 467 aa27.29■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 AUHQ13825 339 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 BARGINQ6ZT62 677 aa27.29■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa27.29■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 MIEF2Q96C03 454 aa27.29■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 CEP83Q9Y592 693 aa27.29■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 CERS5Q8N5B7 392 aa27.29■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 RIPK2O43353 540 aa27.28■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 NFIAQ12857 509 aa27.28■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 ITIH4Q14624 930 aa27.28■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 CNGA2Q16280 664 aa27.28■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 CCDC25Q86WR0 208 aa27.28■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 SLF2Q8IX21 1173 aa27.28■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa27.28■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 ANKRD62A6NC57 917 aa27.28■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 RGL2O15211 777 aa27.28■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 UBOX5O94941 541 aa27.28■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 BANK1Q8NDB2 785 aa27.28■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 TBC1D16Q8TBP0 767 aa27.28■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 BTBD6Q96KE9 485 aa27.28■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 DNAJC18Q9H819 358 aa27.28■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 SAMD15Q9P1V8 674 aa27.28■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 C6orf229H3BNL8 230 aa27.27■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 CHMP2AO43633 222 aa27.27■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 EEF2P13639 858 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 ATP2B4P23634 1241 aa27.27■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 Q4G0T1 1027 aa27.27■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 APEX2Q9UBZ4 518 aa27.27■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 FAM13AO94988 1023 aa27.27■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 EYA4O95677 639 aa27.27■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 FTLP02792 175 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 PYGMP11217 842 aa27.27■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 LONRF1Q17RB8 773 aa27.27■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 ACP6Q9NPH0 428 aa27.27■■□□□ 1.96
SENP3-201ENST00000321337 AGTP01019 485 aa27.26■■□□□ 1.95
SENP3-201ENST00000321337 DRG2P55039 364 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
SENP3-201ENST00000321337 MESDQ14696 234 aa27.26■■□□□ 1.95
SENP3-201ENST00000321337 C6orf118Q5T5N4 469 aa27.26■■□□□ 1.95
SENP3-201ENST00000321337 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.26■■□□□ 1.95
SENP3-201ENST00000321337 EXOC3L1Q86VI1 746 aa27.26■■□□□ 1.95
SENP3-201ENST00000321337 TPH2Q8IWU9 490 aa27.26■■□□□ 1.95
SENP3-201ENST00000321337 FIZ1Q96SL8 496 aa27.26■■□□□ 1.95
SENP3-201ENST00000321337 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa27.26■■□□□ 1.95
SENP3-201ENST00000321337 OLFML3Q9NRN5 406 aa27.26■■□□□ 1.95
SENP3-201ENST00000321337 COMTP21964 271 aa27.26■■□□□ 1.95
SENP3-201ENST00000321337 SLC8A1P32418 973 aa27.26■■□□□ 1.95
SENP3-201ENST00000321337 DLG4P78352 724 aa27.26■■□□□ 1.95
SENP3-201ENST00000321337 EP400NLQ6ZTU2 488 aa27.26■■□□□ 1.95
SENP3-201ENST00000321337 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
SENP3-201ENST00000321337 AGPAT1Q99943 283 aa27.26■■□□□ 1.95
SENP3-201ENST00000321337 RASAL2Q9UJF2 1139 aa27.26■■□□□ 1.95
SENP3-201ENST00000321337 RASGRF2O14827 1237 aa27.25■■□□□ 1.95
SENP3-201ENST00000321337 SLC26A4O43511 780 aa27.25■■□□□ 1.95
SENP3-201ENST00000321337 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms