RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290921.10

CTBP1-201, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTBP1, Length 2,297 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-201ENST00000290921 NEK9Q8TD19 979 aa27.3■■□□□ 1.96
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CTBP1-201ENST00000290921 TRIM49CP0CI26 452 aa27.29■■□□□ 1.96
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CTBP1-201ENST00000290921 SELENOSQ9BQE4 189 aa27.28■■□□□ 1.96
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CTBP1-201ENST00000290921 DMAC2Q9NW81 257 aa27.25■■□□□ 1.95
CTBP1-201ENST00000290921 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP27.25■■□□□ 1.952e-7■■■■□ 25.9
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CTBP1-201ENST00000290921 SEL1LQ9UBV2 794 aa27.25■■□□□ 1.95
CTBP1-201ENST00000290921 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CTBP1-201ENST00000290921 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CTBP1-201ENST00000290921 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CTBP1-201ENST00000290921 XRCC4Q13426 336 aa27.25■■□□□ 1.95
CTBP1-201ENST00000290921 PPP2R5AQ15172 486 aa27.25■■□□□ 1.95
CTBP1-201ENST00000290921 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CTBP1-201ENST00000290921 STRIP1Q5VSL9 837 aa27.25■■□□□ 1.95
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