RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 NVLO15381 856 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 GNAQP50148 359 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 RCN2Q14257 317 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 TNIP1Q15025 636 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 PRELID2Q8N945 189 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 BICD1Q96G01 975 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 ZNF333Q96JL9 665 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 PARP2Q9UGN5 583 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 CHKBQ9Y259 395 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 DCCP43146 1447 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 VCAM1P19320 739 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 PPATQ06203 517 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 SETDB1Q15047 1291 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 MTMR9Q96QG7 549 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 PITPNM3Q9BZ71 974 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 INTUQ9ULD6 942 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 SLC37A4O43826 429 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 TFAP4Q01664 338 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 KLHL23Q8NBE8 558 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 RFFLQ8WZ73 363 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 GFPT2O94808 682 aa22.84■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 GYG1P46976 350 aa22.84■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.84■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.84■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 MAIP1Q8WWC4 291 aa22.84■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 MAGEB18Q96M61 343 aa22.84■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 RUNDC3BQ96NL0 473 aa22.84■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.84■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 TMEM260Q9NX78 707 aa22.84■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 NR2F2P24468 414 aa22.84■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 FOXN2P32314 431 aa22.84■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 KRT79Q5XKE5 535 aa22.84■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.84■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 ATL2Q8NHH9 583 aa22.84■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 USP40Q9NVE5 1235 aa22.84■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 TNS2Q63HR2 1409 aa22.83■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 ATP5HO75947 161 aa22.83■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 TAC1P20366 129 aa22.83■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 CHRNA3P32297 505 aa22.83■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.258e-8■□□□□ 10.1
ODC1-201ENST00000234111 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.83■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 ARHGEF26Q96DR7 871 aa22.83■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 SERPINB12Q96P63 405 aa22.83■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
ODC1-201ENST00000234111 ATP8B3O60423 1300 aa22.83■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 PODXLO00592 558 aa22.83■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 CBX6O95503 412 aa22.83■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 PDIA5Q14554 519 aa22.83■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 WASHC2DQ5SRD0 308 aa22.83■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 INPP5DQ92835 1189 aa22.83■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 LRRC37BQ96QE4 947 aa22.83■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.83■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 LRCH1Q9Y2L9 728 aa22.83■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 CACNA1SQ13698 1873 aa22.82■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.82■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.82■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 SIGLEC16A6NMB1 481 aa22.82■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 CETN3O15182 167 aa22.82■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 TDP2O95551 362 aa22.82■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 T-ENOLP0DO92 83 aa22.82■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.82■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 CCNJLQ8IV13 435 aa22.82■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 LRRC8CQ8TDW0 803 aa22.82■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 ART4Q93070 314 aa22.82■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 OCEL1Q9H607 264 aa22.82■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 USP20Q9Y2K6 914 aa22.82■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 NCANO14594 1321 aa22.82■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 ATP9AO75110 1047 aa22.82■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 KCNA3P22001 575 aa22.82■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 JAM2P57087 298 aa22.82■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 C6orf50Q9HD87 102 aa22.82■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa22.82■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 TBK1Q9UHD2 729 aa22.82■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 PCYOX1Q9UHG3 505 aa22.82■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 ANXA13P27216 316 aa22.81■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 MARCKSL1P49006 195 aa22.81■■□□□ 1.24
ODC1-201ENST00000234111 CYP4X1Q8N118 509 aa22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms