RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 ASIC2Q16515 512 aa20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 SPAG5Q96R06 1193 aa20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 EFCC1Q9HA90 598 aa20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 PCNTO95613 3336 aa20.3■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.3■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 MYBPC2Q14324 1141 aa20.3■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 EMC2Q15006 297 aa20.3■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 TEX35Q5T0J7 233 aa20.3■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 TMEM63BQ5T3F8 832 aa20.3■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 IQCEQ6IPM2 695 aa20.3■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.3■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 C12orf56Q8IXR9 622 aa20.3■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 XXYLT1Q8NBI6 393 aa20.3■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.3■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 TMEM143Q96AN5 459 aa20.3■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa20.29■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 ADRB2P07550 413 aa20.29■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 PLA2G4AP47712 749 aa20.29■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 KLHL30Q0D2K2 578 aa20.29■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 KIF5AQ12840 1032 aa20.29■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.29■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20.29■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 SPIRE2Q8WWL2 714 aa20.29■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 SAAL1Q96ER3 474 aa20.29■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.29■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 GRIN3BO60391 1043 aa20.29■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 LRRN2O75325 713 aa20.29■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 MAGEA1P43355 309 aa20.29■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 MYL7Q01449 175 aa20.29■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.29■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 ILDR2Q71H61 639 aa20.29■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.29■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.29■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 USP20Q9Y2K6 914 aa20.29■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 CNGA1P29973 690 aa20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 JAM2P57087 298 aa20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 PPP3CAQ08209 521 aa20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 NEDD9Q14511 834 aa20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 TAS1R3Q7RTX0 852 aa20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 EMSYQ7Z589 1322 aa20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 A0A087X0T9 212 aa20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 FAM228BP0C875 321 aa20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 KRT13P13646 458 aa20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 VAMP7P51809 220 aa20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 PTK2Q05397 1052 aa20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 METTL7BQ6UX53 244 aa20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 TRIM50Q86XT4 487 aa20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 TMEM174Q8WUU8 243 aa20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 CEP89Q96ST8 783 aa20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 CDC23Q9UJX2 597 aa20.28■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 PDHXO00330 501 aa20.27■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 GCLMP48507 274 aa20.27■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.27■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.27■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 MROH8Q9H579 483 aa20.27■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.27■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa20.27■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 BTBD19C9JJ37 291 aa20.27■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.27■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 TGFB3P10600 412 aa20.27■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 COPB2P35606 906 aa20.27■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 STAT5BP51692 787 aa20.27■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 AMPD2Q01433 879 aa20.27■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 CEP112Q8N8E3 955 aa20.27■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 ASAP3Q8TDY4 903 aa20.27■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 COPS5Q92905 334 aa20.27■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 PARD6BQ9BYG5 372 aa20.27■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 EPC1Q9H2F5 836 aa20.27■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 ST7Q9NRC1 585 aa20.27■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.27■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.26■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 RTP1P59025 263 aa20.26■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 CCL15Q16663 113 aa20.26■□□□□ 0.83
SIKE1-201ENST00000060969 HVCN1Q96D96 273 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms