RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ano5Q75UR0 904 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tas2r134Q7TQB0 298 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5622Q810Q0 167 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 L3mbtl3Q8BLB7 883 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fbxo38Q8BMI0 1194 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Skor1Q8BX46 964 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Agap1Q8BXK8 857 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Iffo1Q8BXL9 562 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Strip1Q8C079 837 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem120aQ8C1E7 343 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vps52Q8C754 723 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CnstQ8CBC4 711 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Grtp1Q9D3N8 359 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eya4Q9Z191 616 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf394Q9Z1D9 521 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kmt2eQ3UG20 1868 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Syngap1F6SEU4 1340 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Osbpl7A2A716 963 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Apol8A2VDH7 339 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RcvrnP34057 202 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Syne3Q4FZC9 975 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serpinb1cQ5SV42 375 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Map3k12Q60700 888 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc113Q8C5T8 377 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcdhgb4Q91XX6 912 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spc24Q9D083 201 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tacc3Q9JJ11 631 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hebp1Q9R257 190 aa7.12□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Brwd3A2AHJ4 1799 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Astn1Q61137 1302 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Patl2A2ARM1 529 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrrc38A2VDH3 298 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Qtrt2B8ZXI1 415 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zc3h7bF8VPP8 982 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Casq2O09161 415 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rab21P35282 222 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Creb1Q01147 341 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smarcad1Q04692 1021 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q3TTJ4 293 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Xxylt1Q3U4G3 392 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10488Q4KL05 212 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppp2r5eQ61151 467 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Grik5Q61626 979 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dlg4Q62108 724 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ugt1a9Q62452 528 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Daam2Q80U19 1115 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Enoph1Q8BGB7 257 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Depdc1bQ8BH88 529 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nop53Q8BK35 484 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AgpsQ8C0I1 645 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cypt1Q8CH20 168 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Depdc1aQ8CIG0 804 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rassf9Q8K342 435 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dcaf8Q8N7N5 591 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpsm2Q8VDU0 679 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Azi2Q9QYP6 405 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Myo5aQ99104 1853 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nup62clA2AG10 272 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ace3D0G895 737 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm4297D3YWB7 211 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adam7O35227 789 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eif3dO70194 548 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tp53P02340 387 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mgat1P27808 447 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Oprl1P35377 367 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 IvlP48997 467 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GclcP97494 637 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nlrp14Q6B966 993 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fbxo11Q7TPD1 930 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TbataQ7TSD4 393 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MslnlQ8C160 685 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PreplQ8C167 725 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pih1h3bQ8C6P5 218 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp2a1Q8R429 994 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc14a1Q8VHL0 384 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tti1Q91V83 1085 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Yipf1Q91VU1 306 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Anapc4Q91W96 807 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc124Q9D8X2 217 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rfwd2Q9R1A8 733 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RptorQ8K4Q0 1335 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Col5a2Q3U962 1497 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cep85lA0A1W2P884 806 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Idh1O88844 414 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fgfr4Q03142 799 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vps41Q5KU39 853 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ctnna2Q61301 953 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcnt1Q6ZPR4 1224 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P2ry10Q8BFU7 328 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tbc1d10cQ8C9V1 444 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kat5Q8CHK4 513 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Unc5bQ8K1S3 945 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atxn7Q8R4I1 867 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Themis2Q91YX0 663 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chchd3Q9CRB9 227 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Snx10Q9CWT3 201 aa7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nop56Q9D6Z1 580 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
Clrn3-201ENSMUST00000053716 IkbipQ9DBZ1 373 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.6 ms