RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dph6Q9CQ28 267 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 IscuQ9D7P6 168 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PigoQ9JJI6 1093 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Myo5aQ99104 1853 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdk14O35495 469 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc16a2O70324 545 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ctc1Q5SUQ9 1212 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 OgdhQ60597 1023 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Msantd2Q6NZR2 559 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ano5Q75UR0 904 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TwistnbQ78WZ7 330 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc186Q8C9S4 917 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ranbp17Q99NF8 1088 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rnf113a2Q14B01 337 aa18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Serpinb6Q60854 378 aa18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ddx31Q6NZQ2 687 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GmipQ6PGG2 971 aa18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rusc1Q8BG26 893 aa18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Depdc1bQ8BH88 529 aa18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RalylQ8BTF8 293 aa18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rtn3Q9ES97 964 aa18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm382B1AXN3 1250 aa18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Parp2O88554 559 aa18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pik3r1P26450 724 aa18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Frmd8Q3UFK8 466 aa18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kcnt1Q6ZPR4 1224 aa18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Btnl9Q8BJE2 536 aa18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zhx2Q8C0C0 836 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plekhg6Q8R0J1 787 aa18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slf1Q8R3P9 1054 aa18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SfpqQ8VIJ6 699 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdhgb4Q91XX6 912 aa18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tlr5Q9JLF7 859 aa18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cfap70D3YVL2 1141 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp266E9Q2S7 604 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MyocO70624 490 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc27a3O88561 667 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mgat1P27808 447 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RxrbP28704 520 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pbxip1Q3TVI8 727 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ugt1a9Q62452 528 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tfe3Q64092 572 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q8BGC1 442 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam20aQ8CID3 541 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Xpo6Q924Z6 1125 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gimap4Q99JY3 219 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ddx20Q9JJY4 825 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Grk1Q9WVL4 564 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cntnap1O54991 1385 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm45194A0A140LJG2 572 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pex5O09012 639 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tex35Q14BK3 207 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TraddQ3U0V2 310 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mier3Q3UHF3 551 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vwa3aQ3UVV9 1148 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prr7Q3V0I2 269 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Xlr3bQ6P205 226 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vgll2Q8BGW8 322 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q8C6G1 249 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 BbxQ8VBW5 907 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spdl1Q923A2 608 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ttc5Q99LG4 440 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Asb11Q9CQ31 323 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mrpl11Q9CQF0 192 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tbc1d16A2ABG4 766 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mms22lB1AUR6 1238 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prl6a1O35257 230 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam207aP58468 219 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cep126Q0VBV7 1103 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc92bQ5SUE3 299 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ctnna2Q61301 953 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Churc1Q6DG52 112 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PicalmQ7M6Y3 660 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmx4Q8C0L0 335 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CgasQ8C6L5 507 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Unc5bQ8K1S3 945 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tdrd3Q91W18 743 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nmrk1Q91W63 195 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ssr1Q9CY50 286 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sf3a3Q9D554 501 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc5a4aQ9ET37 656 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rnf4Q9QZS2 194 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 4930544D05RikJ3QK56 214 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Csf1rP09581 977 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Styk1Q6J9G1 429 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gramd4Q8CB44 633 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bst2Q8R2Q8 172 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tcirg1Q9JHF5 834 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rnf103Q9R1W3 683 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nfs1Q9Z1J3 459 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 C87977A2A958 498 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Serpina1aP07758 413 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyp11b2P15539 500 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Serpina1cQ00896 412 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Serpina1dQ00897 413 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rrp36Q3UFY0 244 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp957Q3UT76 567 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc10a5Q5PT54 434 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sun2Q8BJS4 731 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc12a8Q8VI23 705 aa18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.2 ms