RNA–Protein interactions for RNA: YOR242C

SSP2, Transcript of Sporulation specific protein that localizes to the spore wall, yeast

Gene SSP2, Length 1,116 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSP2	YOR242C	YMR134W	P40207	237 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SSP2	YOR242C	MGR3	Q04472	501 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SSP2	YOR242C	CSM3	Q04659	317 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SSP2	YOR242C	MRX8	Q05473	314 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SSP2	YOR242C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SSP2	YOR242C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SSP2	YOR242C	HST4	P53688	370 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSP2	YOR242C	SED5	Q01590	340 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SSP2	YOR242C	CIN8	P27895	1000 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	URA10	P30402	227 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	MKK1	P32490	508 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	YKL071W	P36086	256 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	NAS2	P40555	220 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	ALE1	Q08548	619 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	UTR1	P21373	530 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	YCH1	P42937	148 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	NRM1	P53718	249 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	HCH1	P53834	153 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	SPH1	Q06160	661 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	RBK1	P25332	333 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	ERG9	P29704	444 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	ITR2	P30606	609 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	AGA2	P32781	87 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	CYM1	P32898	989 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	MYO3	P36006	1272 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	FRM2	P37261	193 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	IML3	P38265	245 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	POP2	P39008	433 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	BUR2	Q05949	395 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	TAF10	Q12030	206 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	RAD1	P06777	1100 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	TIP20	P33891	701 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	SRB2	P34162	210 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	TAE1	P38340	232 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	TRR2	P38816	342 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	UFE1	P41834	346 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	YFR018C	P43599	363 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	REX3	Q12090	404 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	YDL211C	Q12121	372 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	RPN6	Q12377	434 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	SPO24	Q3E752	67 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	COX10	P21592	462 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	PEX32	P38292	413 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	RRF1	P38771	230 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	PES4	P39684	611 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	YIR035C	P40579	254 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	HIT1	P46973	164 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	SHE4	P51534	789 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	INP2	Q03824	705 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	YDR018C	Q12185	396 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	YDR262W	Q12331	272 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	CTA1	P15202	515 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	DCC1	P25559	380 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	AST1	P35183	429 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	MMS21	P38632	267 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	BDH1	P39714	382 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	CPR7	P47103	393 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	NAS6	P50086	228 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	GAL3	P13045	520 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	ACB1	P31787	87 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	MEI5	P32489	222 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	END3	P39013	349 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	TAF6	P53040	516 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	ZRG17	P53735	605 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	YMR244W	Q04018	355 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SSP2	YOR242C	CKA2	P19454	339 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SSP2	YOR242C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SSP2	YOR242C	EFM1	P38732	585 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SSP2	YOR242C	GPI8	P49018	411 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SSP2	YOR242C	YGR168C	P53293	376 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SSP2	YOR242C	INP1	Q03694	420 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SSP2	YOR242C	YLR297W	Q05899	129 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SSP2	YOR242C	VPS63	O13549	108 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SSP2	YOR242C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SSP2	YOR242C	DAL5	P15365	543 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SSP2	YOR242C	IME2	P32581	645 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SSP2	YOR242C	SUR1	P33300	382 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SSP2	YOR242C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SSP2	YOR242C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SSP2	YOR242C	SAL1	D6W196	494 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SSP2	YOR242C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SSP2	YOR242C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SSP2	YOR242C	YMR262W	P38430	313 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SSP2	YOR242C	SSO2	P39926	295 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SSP2	YOR242C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SSP2	YOR242C	YIL059C	P40520	121 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SSP2	YOR242C	MHP1	P43638	1398 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SSP2	YOR242C	TPC1	P53257	314 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SSP2	YOR242C	FAR10	Q06001	478 aa		3.06	□□□□□ -1.92

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